More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3173 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 369 aa  764    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  71.47 
 
 		 365 aa  535  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  67.82 
 
 		 384 aa  528  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  70.14 
 
 		 370 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  67.85 
 
 		 371 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  68.39 
 
 		 371 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  67.31 
 
 		 365 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  67.31 
 
 		 365 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  67.04 
 
 		 365 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  67.24 
 
 		 365 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  65.65 
 
 		 366 aa  489  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  53.04 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  52.46 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  51.9 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  54.73 
 
 		 370 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  51.36 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  50.82 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  53.12 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  53.85 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  51.53 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  52.2 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  51.38 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  51.79 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  50.82 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  50.69 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  53.96 
 
 		 357 aa  368  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  52.21 
 
 		 361 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  54.93 
 
 		 358 aa  365  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  49.17 
 
 		 356 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  50.55 
 
 		 359 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  52.94 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  52.51 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  52.49 
 
 		 356 aa  360  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  51.1 
 
 		 361 aa  359  4e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  49.86 
 
 		 361 aa  358  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  48.79 
 
 		 373 aa  357  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  52.34 
 
 		 358 aa  357  2.9999999999999997e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  50.54 
 
 		 372 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  50.27 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  50.14 
 
 		 356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  55 
 
 		 367 aa  353  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  50.27 
 
 		 364 aa  352  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  50.14 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  52.66 
 
 		 365 aa  349  4e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  51.79 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  48.76 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  50.14 
 
 		 360 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  50.27 
 
 		 358 aa  344  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  39.2 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  38.66 
 
 		 373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 366 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  39.5 
 
 		 425 aa  232  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  37.57 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  39 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  41.78 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  39.5 
 
 		 357 aa  230  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  37.29 
 
 		 371 aa  230  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  37.74 
 
 		 373 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  38.32 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  40.85 
 
 		 393 aa  227  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.97 
 
 		 357 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  39.65 
 
 		 396 aa  226  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  39.45 
 
 		 363 aa  225  7e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  36.26 
 
 		 389 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  37.97 
 
 		 366 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  39.24 
 
 		 386 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.38 
 
 		 362 aa  225  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  39.27 
 
 		 405 aa  225  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4324  ABC transporter-related protein  43.05 
 
 		 361 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.935984 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  40.52 
 
 		 365 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  39.27 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  39.67 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  39.27 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  40.33 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  41 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  39.17 
 
 		 352 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.58 
 
 		 356 aa  223  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.82 
 
 		 362 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.24 
 
 		 359 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.46 
 
 		 356 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  35.99 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  35.99 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  38.24 
 
 		 359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  37.5 
 
 		 360 aa  223  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  39.94 
 
 		 356 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  43.21 
 
 		 358 aa  222  7e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  36.99 
 
 		 355 aa  222  9e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  43.45 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  42.81 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  36.86 
 
 		 372 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.48 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1158  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.46 
 
 		 372 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  43.02 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5678  ABC transporter related  36.59 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209131  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  37.1 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  38.68 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.72 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  39.94 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  34.9 
 
 		 363 aa  220  3e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>