More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0379 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  100 
 
 		 384 aa  797    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  71.66 
 
 		 365 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  69.95 
 
 		 371 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  68.56 
 
 		 370 aa  529  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  67.82 
 
 		 369 aa  528  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  69.13 
 
 		 371 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  67.21 
 
 		 365 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  66.12 
 
 		 365 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  65.85 
 
 		 365 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  66.76 
 
 		 365 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  65.12 
 
 		 366 aa  496  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  56.47 
 
 		 356 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  54.64 
 
 		 359 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  55.92 
 
 		 356 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  54.25 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  54.36 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  52.59 
 
 		 370 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  53.7 
 
 		 356 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  53.97 
 
 		 365 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  53.04 
 
 		 362 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  51.61 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  53.15 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  53.15 
 
 		 365 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  52.32 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  52.99 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  52.19 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  52.19 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  53.41 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  54.18 
 
 		 366 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  52.05 
 
 		 357 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  52.86 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  51.5 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  52.55 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  52.73 
 
 		 361 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  55.43 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  51.09 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  52.88 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  52.05 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  52.73 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  52.59 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  52.19 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  51.5 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  51.51 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  50.95 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  50.68 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  50.95 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  51.65 
 
 		 365 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 373 aa  350  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  38.66 
 
 		 379 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  43.27 
 
 		 358 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  40.52 
 
 		 355 aa  244  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  39.06 
 
 		 357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  42.06 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  40.79 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  42.51 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  38.54 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  39.05 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  38.61 
 
 		 356 aa  240  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  37.13 
 
 		 367 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  42.24 
 
 		 359 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  44.67 
 
 		 430 aa  239  5e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  37.71 
 
 		 367 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.71 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  37.5 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.43 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  41.05 
 
 		 425 aa  237  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  39.88 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.43 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.43 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.43 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.43 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.43 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  38.46 
 
 		 367 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.43 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1725  ABC transporter related  40.81 
 
 		 361 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146512  normal  0.897098 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  37 
 
 		 373 aa  236  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  39.44 
 
 		 405 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  41.12 
 
 		 391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.43 
 
 		 366 aa  236  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  39.44 
 
 		 405 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  39.44 
 
 		 405 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  37.71 
 
 		 365 aa  235  9e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  37.71 
 
 		 365 aa  235  9e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  39.22 
 
 		 371 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  42.14 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  41.81 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  36.24 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  38.3 
 
 		 375 aa  234  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  42.16 
 
 		 365 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1158  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.67 
 
 		 372 aa  234  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  37.15 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  37.15 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  43.96 
 
 		 358 aa  233  5e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  39.37 
 
 		 356 aa  232  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  42.14 
 
 		 356 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  39.66 
 
 		 396 aa  232  8.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  40.27 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  39.88 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 370 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  39.27 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>