More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3047 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 365 aa  744    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  92.88 
 
 		 365 aa  695    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  92.33 
 
 		 365 aa  692    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  73 
 
 		 370 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  69.32 
 
 		 362 aa  511  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  62.81 
 
 		 357 aa  463  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  63.71 
 
 		 356 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  62.91 
 
 		 359 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  63.09 
 
 		 357 aa  451  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  61.71 
 
 		 360 aa  443  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  61.26 
 
 		 356 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  60.94 
 
 		 358 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  60.81 
 
 		 359 aa  429  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  59.4 
 
 		 366 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  58.56 
 
 		 358 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  57.81 
 
 		 366 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  58.9 
 
 		 372 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  57.85 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  60.63 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  57.62 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.62 
 
 		 365 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  56.63 
 
 		 366 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  56.87 
 
 		 367 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  54.25 
 
 		 384 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  55.92 
 
 		 360 aa  398  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  56.2 
 
 		 361 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  55.1 
 
 		 361 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  57.31 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  59.13 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  55.34 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  55.92 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  55.96 
 
 		 365 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  55.12 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  58.7 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  52.91 
 
 		 370 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  54.95 
 
 		 367 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  60.31 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  59.33 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  58.02 
 
 		 367 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  60.62 
 
 		 357 aa  383  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  54.82 
 
 		 371 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  52.46 
 
 		 369 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  54.4 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  53.58 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  55.62 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  56.55 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  53.19 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  51.42 
 
 		 365 aa  327  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0703  ABC transporter related  41.01 
 
 		 369 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  43.73 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  40.39 
 
 		 381 aa  235  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  38.2 
 
 		 386 aa  235  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  38.2 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  38.41 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  38.55 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  40 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.57 
 
 		 357 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.88 
 
 		 352 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  38.83 
 
 		 386 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  41.12 
 
 		 384 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.57 
 
 		 357 aa  227  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3453  ABC transporter related  40.37 
 
 		 377 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  37.73 
 
 		 384 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  38.01 
 
 		 384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  37.73 
 
 		 384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5862  ABC transporter related  37.63 
 
 		 369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  40.78 
 
 		 363 aa  226  6e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  39.17 
 
 		 364 aa  225  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  37.43 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  38.76 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  38.82 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4985  ABC transporter related  36.24 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5686  ABC transporter related  40.54 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.661701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  42.52 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 425 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  39.93 
 
 		 373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  38.79 
 
 		 359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  43.62 
 
 		 398 aa  222  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  36.84 
 
 		 366 aa  222  9e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  42.47 
 
 		 403 aa  222  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6268  ABC transporter related  40.29 
 
 		 372 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  37.39 
 
 		 364 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  39.03 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1050  ABC transporter related  41.96 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  37.32 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  39.94 
 
 		 385 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  38.27 
 
 		 368 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  38.27 
 
 		 368 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  39.19 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  39.6 
 
 		 338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  41.42 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  43.92 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6630  ABC transporter related  40.24 
 
 		 377 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  40.33 
 
 		 368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.71 
 
 		 359 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.2 
 
 		 349 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  38.07 
 
 		 377 aa  220  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.53 
 
 		 376 aa  219  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.18 
 
 		 360 aa  219  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.17 
 
 		 377 aa  219  6e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>