More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2233 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  84.74 
 
 		 372 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 366 aa  752    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  69.86 
 
 		 359 aa  508  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  67.4 
 
 		 358 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  67.67 
 
 		 356 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  66.94 
 
 		 357 aa  502  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  65.57 
 
 		 356 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  66.58 
 
 		 357 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  66.85 
 
 		 358 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  65.11 
 
 		 360 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  59.4 
 
 		 365 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  58.31 
 
 		 365 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  58.58 
 
 		 365 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  55.59 
 
 		 362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  55.71 
 
 		 370 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  57.49 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  54.18 
 
 		 384 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  54.44 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  58.93 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  54.5 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  58.57 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  58.26 
 
 		 357 aa  378  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  55.71 
 
 		 365 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  61.11 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  60.83 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  61.59 
 
 		 367 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  55.56 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  57.58 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  61.44 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  61.27 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  52.91 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  57.94 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  58.26 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  52.85 
 
 		 365 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  51.9 
 
 		 370 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  55.75 
 
 		 358 aa  361  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  58.64 
 
 		 361 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  54.75 
 
 		 365 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  57.68 
 
 		 361 aa  359  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  58.44 
 
 		 371 aa  358  7e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 		 371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  57.05 
 
 		 361 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  50.27 
 
 		 369 aa  353  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  56.3 
 
 		 360 aa  351  8.999999999999999e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  57.01 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  50.4 
 
 		 371 aa  347  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  47.9 
 
 		 365 aa  295  9e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  39.52 
 
 		 372 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  40.67 
 
 		 353 aa  224  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  40.85 
 
 		 357 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  40.59 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  40.06 
 
 		 365 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  43.22 
 
 		 363 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  42.86 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.26 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3407  ABC transporter related  41.82 
 
 		 368 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.33 
 
 		 349 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  38.01 
 
 		 363 aa  216  5e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4324  ABC transporter-related protein  40.59 
 
 		 361 aa  216  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.935984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  37.84 
 
 		 368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  41.45 
 
 		 358 aa  215  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  39.16 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  42.7 
 
 		 357 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  38.69 
 
 		 375 aa  215  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  39.5 
 
 		 357 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.81 
 
 		 362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  39.18 
 
 		 381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  38.51 
 
 		 361 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9197  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.64 
 
 		 359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  37.61 
 
 		 354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  41.08 
 
 		 393 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  38.07 
 
 		 357 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  36.69 
 
 		 375 aa  213  5.999999999999999e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.13 
 
 		 349 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  40.27 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.91 
 
 		 362 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  41.11 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  38.61 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  38.06 
 
 		 377 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  38.21 
 
 		 370 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4396  ABC transporter related protein  40.07 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.510739  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  44.19 
 
 		 355 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  37.92 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  38.29 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.99 
 
 		 363 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  41.82 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  39.16 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  42.16 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  37.94 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  37.99 
 
 		 384 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.86 
 
 		 366 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 361 aa  210  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  38.27 
 
 		 332 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  40.31 
 
 		 418 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1719  ABC transporter related  38 
 
 		 364 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  40.65 
 
 		 356 aa  210  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  40.34 
 
 		 353 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.32 
 
 		 356 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>