More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1593 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  100 
 
 		 358 aa  728    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  73.31 
 
 		 356 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  71.07 
 
 		 356 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  71.35 
 
 		 356 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  72.75 
 
 		 364 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  71.63 
 
 		 356 aa  523  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  64.41 
 
 		 371 aa  462  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  63.46 
 
 		 361 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  62.89 
 
 		 361 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  62.99 
 
 		 367 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  62.54 
 
 		 361 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  60.51 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  61.56 
 
 		 360 aa  421  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  57.3 
 
 		 357 aa  408  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  57.54 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.26 
 
 		 365 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  58.26 
 
 		 365 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  57.98 
 
 		 365 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  56.25 
 
 		 357 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  56.64 
 
 		 357 aa  388  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  59.33 
 
 		 365 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  58.03 
 
 		 367 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  59.75 
 
 		 365 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  58.13 
 
 		 367 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  53.44 
 
 		 366 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  52.86 
 
 		 384 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  55.56 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  57.26 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  57.38 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  55.65 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  59.44 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  54.4 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  57.23 
 
 		 365 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  55.28 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  55.31 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  55.1 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  55.95 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  53.02 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  58.91 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  54.89 
 
 		 373 aa  368  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  54.23 
 
 		 358 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  54.49 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  56.33 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  55.22 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  55.75 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  50.27 
 
 		 369 aa  344  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  50.93 
 
 		 365 aa  310  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  38.38 
 
 		 357 aa  235  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  37.09 
 
 		 367 aa  233  5e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  38.52 
 
 		 364 aa  228  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  40.41 
 
 		 358 aa  228  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  38.24 
 
 		 398 aa  225  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  34.99 
 
 		 359 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  36.54 
 
 		 355 aa  223  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.69 
 
 		 366 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 399 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.69 
 
 		 366 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  41.43 
 
 		 364 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  38.17 
 
 		 358 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  37.58 
 
 		 366 aa  222  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  35.8 
 
 		 355 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  35.8 
 
 		 367 aa  222  8e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  35.8 
 
 		 367 aa  222  8e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  36.41 
 
 		 384 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  35.84 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  39.38 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  36.7 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  35.84 
 
 		 367 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.98 
 
 		 366 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  38 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  40.68 
 
 		 352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  36.34 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.98 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  38.12 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  36.63 
 
 		 370 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.39 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  36.63 
 
 		 370 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  36.26 
 
 		 381 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  37.09 
 
 		 366 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  38.32 
 
 		 377 aa  219  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  36.14 
 
 		 384 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  33.61 
 
 		 365 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  37.09 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.93 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6630  ABC transporter related  37.8 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  36.8 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  36.8 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  35.88 
 
 		 355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  36.13 
 
 		 352 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  37.91 
 
 		 368 aa  216  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  36.18 
 
 		 366 aa  216  5e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  35.77 
 
 		 389 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  40.82 
 
 		 369 aa  216  5.9999999999999996e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  36.7 
 
 		 377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5686  ABC transporter related  38.41 
 
 		 377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.661701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  35.85 
 
 		 353 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>