More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1973 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  100 
 
 
360 aa  711    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  70.36 
 
 
366 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  68.51 
 
 
367 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  69.06 
 
 
367 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  65.46 
 
 
360 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  66.3 
 
 
367 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  65.53 
 
 
361 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  64.67 
 
 
361 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  62.96 
 
 
371 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  64.2 
 
 
367 aa  445  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  64.67 
 
 
361 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  61.25 
 
 
356 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  61.25 
 
 
356 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  60.85 
 
 
356 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  61.56 
 
 
358 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  60.73 
 
 
357 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  61.08 
 
 
364 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  58.84 
 
 
356 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  58.87 
 
 
357 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  56.42 
 
 
359 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  57.73 
 
 
365 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.46 
 
 
365 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  57.85 
 
 
365 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  53.74 
 
 
370 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  55.25 
 
 
365 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  58.61 
 
 
356 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  61.08 
 
 
357 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  56.82 
 
 
365 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  56.55 
 
 
365 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  62.86 
 
 
357 aa  388  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  61.21 
 
 
358 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  51.51 
 
 
384 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  56.55 
 
 
365 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  60.62 
 
 
360 aa  381  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  54.34 
 
 
366 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  53.87 
 
 
371 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  53.28 
 
 
371 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  56.9 
 
 
365 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  56.55 
 
 
358 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  62.18 
 
 
359 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  57.26 
 
 
372 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  55.38 
 
 
373 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  56.3 
 
 
366 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  63.57 
 
 
356 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  58.33 
 
 
370 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  55.56 
 
 
362 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  50.14 
 
 
369 aa  357  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  48.6 
 
 
365 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  40.65 
 
 
359 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  42.05 
 
 
357 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  44.34 
 
 
353 aa  235  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  41.48 
 
 
353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  43.3 
 
 
356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.27 
 
 
352 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  44 
 
 
374 aa  229  8e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  40.24 
 
 
359 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  36.77 
 
 
373 aa  228  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  40.22 
 
 
384 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.03 
 
 
357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  38.02 
 
 
362 aa  226  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0114  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.77 
 
 
359 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  39.39 
 
 
384 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  38.42 
 
 
355 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  37.36 
 
 
365 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  45.21 
 
 
359 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  42.42 
 
 
364 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.21 
 
 
359 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.73 
 
 
357 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.73 
 
 
357 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  45.24 
 
 
396 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  38.14 
 
 
385 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  39.39 
 
 
384 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  42.19 
 
 
353 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  37.57 
 
 
355 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  39.04 
 
 
368 aa  224  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  40.12 
 
 
345 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  39.39 
 
 
384 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1481  ABC transporter related  38.35 
 
 
379 aa  222  9e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00851578  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  42.04 
 
 
361 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  42.37 
 
 
353 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  40.63 
 
 
356 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  41.27 
 
 
355 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  37.12 
 
 
402 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06937  sugar ABC transportor ATP-binding protein  37.29 
 
 
364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 
381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  39.23 
 
 
366 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.07 
 
 
351 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  38.95 
 
 
359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.95 
 
 
356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  39.19 
 
 
371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.52 
 
 
349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  36.66 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  41.16 
 
 
352 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.63 
 
 
356 aa  220  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  41.84 
 
 
389 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  40.63 
 
 
356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.63 
 
 
356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.63 
 
 
356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  40.63 
 
 
356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  40.07 
 
 
367 aa  219  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>