More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2321 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  100 
 
 		 358 aa  730    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  80.73 
 
 		 357 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  81.01 
 
 		 357 aa  589  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  79.55 
 
 		 356 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  77.93 
 
 		 359 aa  579  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  76.67 
 
 		 360 aa  562  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  74.3 
 
 		 356 aa  538  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  72.91 
 
 		 358 aa  537  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  66.85 
 
 		 366 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  65.94 
 
 		 372 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  60 
 
 		 365 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  60 
 
 		 365 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  60.94 
 
 		 365 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  56.39 
 
 		 362 aa  411  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  55.37 
 
 		 370 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  56.11 
 
 		 359 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.47 
 
 		 365 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  56.47 
 
 		 365 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  56.47 
 
 		 365 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  56.87 
 
 		 366 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  58.36 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  56.39 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  58.06 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  55.4 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  51.5 
 
 		 384 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  57.36 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  55.65 
 
 		 357 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  56.3 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  54.02 
 
 		 367 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  54.17 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  52.52 
 
 		 373 aa  375  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  61.21 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  58.93 
 
 		 367 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  50.97 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  54.23 
 
 		 358 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  56.6 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  52.68 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  55.22 
 
 		 371 aa  364  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  59.22 
 
 		 361 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  53.5 
 
 		 361 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  53.57 
 
 		 364 aa  359  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  52.34 
 
 		 369 aa  357  2.9999999999999997e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  52.38 
 
 		 356 aa  355  8.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  50.41 
 
 		 371 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  50.41 
 
 		 370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  51.92 
 
 		 365 aa  352  5e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  49.86 
 
 		 371 aa  348  8e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  51.58 
 
 		 365 aa  333  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.88 
 
 		 356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.88 
 
 		 356 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.88 
 
 		 356 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 356 aa  233  6e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 		 356 aa  233  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.88 
 
 		 356 aa  232  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  38.46 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.46 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  38.46 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.45 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.58 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  40.92 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.46 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.46 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.87 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.55 
 
 		 357 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.87 
 
 		 356 aa  226  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  40.06 
 
 		 367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  40.06 
 
 		 367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.74 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.65 
 
 		 359 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2068  ABC transporter related  40.63 
 
 		 364 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.77 
 
 		 349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  37.19 
 
 		 360 aa  222  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.76 
 
 		 362 aa  222  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  41.02 
 
 		 360 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.77 
 
 		 349 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  40.78 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.76 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  40.32 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  38.28 
 
 		 360 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  37.16 
 
 		 389 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  45.66 
 
 		 398 aa  219  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  41.1 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  40 
 
 		 374 aa  219  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  37.8 
 
 		 360 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  42.76 
 
 		 357 aa  219  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  33.7 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  39.56 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  40.74 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  43 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  39.55 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1158  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.29 
 
 		 372 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  35.89 
 
 		 375 aa  218  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  38.73 
 
 		 375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  37.46 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  39.08 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  38.49 
 
 		 363 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  43.49 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2554  ABC transporter related  37.99 
 
 		 369 aa  216  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.51 
 
 		 357 aa  216  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>