More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2667 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 361 aa  739    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  98.34 
 
 		 361 aa  729    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  89.2 
 
 		 361 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  76.69 
 
 		 367 aa  547  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  70.14 
 
 		 371 aa  513  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  62.15 
 
 		 356 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  61.9 
 
 		 356 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  62.89 
 
 		 358 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  60.28 
 
 		 356 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  64.67 
 
 		 360 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  62.33 
 
 		 364 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  60.23 
 
 		 357 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  60.29 
 
 		 357 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  60 
 
 		 356 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  61.02 
 
 		 366 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  56.2 
 
 		 365 aa  401  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  55.92 
 
 		 365 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.94 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  58.07 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  58.22 
 
 		 365 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  54.32 
 
 		 370 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  58.47 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  59.04 
 
 		 367 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  56.23 
 
 		 365 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  55.1 
 
 		 365 aa  391  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  54.32 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  54.87 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  57.94 
 
 		 365 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  53.91 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  58.03 
 
 		 367 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  57.46 
 
 		 356 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  58.21 
 
 		 365 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  52.73 
 
 		 384 aa  381  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  54.7 
 
 		 370 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  52.89 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  54.93 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  53.12 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  55.06 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  55.21 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  51.67 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  59.55 
 
 		 359 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  53.5 
 
 		 358 aa  362  5.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  51.1 
 
 		 369 aa  359  4e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  58.86 
 
 		 360 aa  358  6e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  57.36 
 
 		 358 aa  358  7e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  56.76 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  57.05 
 
 		 366 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  52.34 
 
 		 365 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  37.93 
 
 		 353 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  36.6 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.25 
 
 		 349 aa  220  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  39.02 
 
 		 353 aa  219  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  39.22 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5799  ABC transporter related protein  44.29 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  36.16 
 
 		 359 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  39.01 
 
 		 351 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  36.16 
 
 		 349 aa  212  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  35.34 
 
 		 365 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  37.38 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.54 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  38.78 
 
 		 362 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.47 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  42.8 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  38.18 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  39.53 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  39.93 
 
 		 361 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  40.28 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  38.3 
 
 		 366 aa  209  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  38.72 
 
 		 352 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  43.06 
 
 		 358 aa  209  5e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  36.31 
 
 		 376 aa  209  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  42.75 
 
 		 364 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.24 
 
 		 357 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.24 
 
 		 357 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  39.06 
 
 		 368 aa  209  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  37.43 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6268  ABC transporter related  38.82 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  37.35 
 
 		 398 aa  209  8e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  36.56 
 
 		 353 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  38.31 
 
 		 354 aa  209  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6133  ABC transporter related  34.17 
 
 		 351 aa  209  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269314  normal  0.315029 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3243  ABC transporter related  35.89 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1699  ABC transporter related  38.76 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  36.69 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  41.94 
 
 		 361 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  34.97 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  39.93 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.24 
 
 		 358 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 335 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  37.69 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  37.9 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  37.61 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  38.02 
 
 		 385 aa  206  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  36.57 
 
 		 368 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  36.48 
 
 		 355 aa  205  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  37.91 
 
 		 354 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  39.66 
 
 		 356 aa  205  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  36.14 
 
 		 366 aa  205  9e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.69 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>