More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1441 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  100 
 
 		 359 aa  737    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.12 
 
 		 365 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  59.78 
 
 		 365 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  59.5 
 
 		 365 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  57.46 
 
 		 371 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  56.51 
 
 		 370 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  56.91 
 
 		 371 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  59.77 
 
 		 365 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  60.81 
 
 		 365 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  56.59 
 
 		 365 aa  425  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  59.6 
 
 		 365 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  59.37 
 
 		 365 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  55.52 
 
 		 366 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  56.94 
 
 		 357 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  56.11 
 
 		 356 aa  412  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  54.64 
 
 		 384 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  56.15 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  56.46 
 
 		 370 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  56.42 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  54.21 
 
 		 362 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  58.61 
 
 		 356 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  55.37 
 
 		 366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  56.98 
 
 		 356 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  57.56 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  56.42 
 
 		 367 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  56.11 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  54.82 
 
 		 367 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  54.19 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  54.85 
 
 		 367 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  54.14 
 
 		 367 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  55.31 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  57.54 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  56.42 
 
 		 356 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  54.6 
 
 		 357 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  56.42 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  54.32 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  54.19 
 
 		 361 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  53.91 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  55.83 
 
 		 357 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  56.52 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  56.11 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  56.72 
 
 		 366 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  53.48 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  53.04 
 
 		 369 aa  386  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  52.78 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  53.91 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  51.61 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  52.78 
 
 		 365 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  37.22 
 
 		 366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.17 
 
 		 352 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  41.32 
 
 		 357 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  41.58 
 
 		 425 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  39.7 
 
 		 365 aa  231  1e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  40.5 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2430  ABC transporter related  36.8 
 
 		 365 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0752854  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4985  ABC transporter related  37.09 
 
 		 369 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.47 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  38.46 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  40 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5862  ABC transporter related  36.54 
 
 		 369 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  41.21 
 
 		 360 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  41.72 
 
 		 418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  35.89 
 
 		 389 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  35.46 
 
 		 386 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  37.43 
 
 		 359 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  40.27 
 
 		 403 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.64 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  36.64 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  40.14 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.64 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.11 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  35.64 
 
 		 386 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  37.33 
 
 		 359 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  37.43 
 
 		 362 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  35.92 
 
 		 366 aa  223  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  36.51 
 
 		 379 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 		 366 aa  222  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  35.11 
 
 		 366 aa  223  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 		 366 aa  222  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 		 366 aa  222  8e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 		 366 aa  222  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 		 366 aa  222  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 		 366 aa  222  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  38.84 
 
 		 368 aa  222  8e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2845  ABC transporter related  39.2 
 
 		 379 aa  222  9e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.649643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0703  ABC transporter related  37.82 
 
 		 369 aa  222  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  36.45 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5634  ABC transporter related  37.85 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  38.03 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  39.88 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  42.62 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.67 
 
 		 436 aa  221  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  38.48 
 
 		 349 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  36.72 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  36.45 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.54 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  34.63 
 
 		 373 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  38.89 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  40.43 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  36.87 
 
 		 359 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>