More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3978 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  100 
 
 		 356 aa  726    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  74.72 
 
 		 356 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  74.44 
 
 		 356 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  73.6 
 
 		 356 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  71.63 
 
 		 364 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  71.63 
 
 		 358 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  60.28 
 
 		 371 aa  433  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  60 
 
 		 361 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  60 
 
 		 361 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  60.56 
 
 		 361 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  60.85 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  57.18 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  58.43 
 
 		 367 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  56.42 
 
 		 359 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  54.65 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  53.74 
 
 		 370 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  57.26 
 
 		 366 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  56.89 
 
 		 365 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  57.23 
 
 		 365 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  56.27 
 
 		 367 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  56.62 
 
 		 367 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.85 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  56.3 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  58.39 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  52.19 
 
 		 384 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  55.65 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  55.62 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  54.12 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  53.44 
 
 		 365 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  55.77 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  54.01 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  56.53 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  54.14 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  55.69 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  53.33 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  51.09 
 
 		 366 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  52.91 
 
 		 371 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  52.35 
 
 		 371 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  53.71 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  58.26 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  49.17 
 
 		 369 aa  363  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  53.41 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  54.68 
 
 		 358 aa  359  4e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  50.54 
 
 		 373 aa  359  4e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  52.38 
 
 		 358 aa  355  8.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  56.7 
 
 		 372 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  53.13 
 
 		 359 aa  354  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  50.31 
 
 		 365 aa  319  5e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  39.27 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.83 
 
 		 352 aa  238  8e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 398 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0114  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.23 
 
 		 359 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  38.96 
 
 		 373 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  38.14 
 
 		 353 aa  232  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  42.75 
 
 		 415 aa  230  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  36.96 
 
 		 358 aa  229  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  39.59 
 
 		 354 aa  229  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  42.03 
 
 		 358 aa  228  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  36.81 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  36.83 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  37.65 
 
 		 359 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  38.79 
 
 		 375 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  42.2 
 
 		 363 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  37.23 
 
 		 363 aa  225  7e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  38.28 
 
 		 355 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  38.72 
 
 		 416 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  39.55 
 
 		 370 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  38.96 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  39.52 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  39.34 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  39.1 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  35.53 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.51 
 
 		 349 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  40.66 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  41.16 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  38.97 
 
 		 379 aa  223  4e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  41.16 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  34.7 
 
 		 365 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.51 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  39.51 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  38.92 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  37.35 
 
 		 359 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.13 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  40 
 
 		 403 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  38.4 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.53 
 
 		 351 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  39.47 
 
 		 350 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.72 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  36.83 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  39.75 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  40.61 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.41 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  36.34 
 
 		 370 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  41.28 
 
 		 430 aa  220  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.7 
 
 		 351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.83 
 
 		 356 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.83 
 
 		 356 aa  219  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.83 
 
 		 356 aa  219  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3148  ABC transporter related  36.93 
 
 		 384 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.35193 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  40 
 
 		 369 aa  219  5e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>