More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5981 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  97.19 
 
 		 356 aa  714    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  100 
 
 		 356 aa  732    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  80.34 
 
 		 356 aa  605  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  74.44 
 
 		 356 aa  560  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  75.78 
 
 		 364 aa  556  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  71.35 
 
 		 358 aa  532  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  63.61 
 
 		 371 aa  464  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  62.4 
 
 		 367 aa  455  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  62.46 
 
 		 361 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  61.9 
 
 		 361 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  61.84 
 
 		 361 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  59.89 
 
 		 357 aa  440  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  61.25 
 
 		 360 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  59.89 
 
 		 367 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  56.47 
 
 		 384 aa  415  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  57.14 
 
 		 357 aa  415  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  56.42 
 
 		 359 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  59.05 
 
 		 367 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  56.98 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  58.76 
 
 		 366 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  58.03 
 
 		 367 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  56.11 
 
 		 366 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  54.85 
 
 		 370 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  56.76 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  57.31 
 
 		 365 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  58.04 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  54.52 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.9 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  56.97 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  54.79 
 
 		 365 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  57.98 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  54.6 
 
 		 365 aa  388  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  53.95 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  56.64 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  57.19 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  54.76 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  55.95 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  56.59 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  58.57 
 
 		 366 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  56.42 
 
 		 359 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  51.53 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  55.36 
 
 		 356 aa  368  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  51.63 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  56.6 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  53.71 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  57.99 
 
 		 372 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  52.65 
 
 		 365 aa  325  9e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  38.11 
 
 		 357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.46 
 
 		 381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  42.64 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  43.05 
 
 		 358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  40.74 
 
 		 363 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  39.44 
 
 		 353 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  39.64 
 
 		 371 aa  230  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  38.59 
 
 		 370 aa  229  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  38.78 
 
 		 398 aa  229  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  37.71 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  38.18 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  37.54 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  36.68 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  35.69 
 
 		 351 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  39.44 
 
 		 354 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  38.46 
 
 		 356 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  36.34 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  36.1 
 
 		 353 aa  225  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  40.26 
 
 		 352 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  39.07 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  38.27 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  39.12 
 
 		 360 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.49 
 
 		 352 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  37.22 
 
 		 367 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  34.46 
 
 		 365 aa  223  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  34.46 
 
 		 365 aa  223  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  40.13 
 
 		 362 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.39 
 
 		 362 aa  223  3e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  37.64 
 
 		 355 aa  223  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  34.22 
 
 		 359 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  41.41 
 
 		 408 aa  223  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  35.46 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  39.94 
 
 		 353 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  35.83 
 
 		 359 aa  222  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  38.03 
 
 		 357 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  37.01 
 
 		 362 aa  223  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9197  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.13 
 
 		 359 aa  223  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  37.42 
 
 		 354 aa  222  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  35.82 
 
 		 363 aa  222  7e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  40.54 
 
 		 380 aa  222  8e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  37.68 
 
 		 362 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  39.73 
 
 		 406 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.33 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  36.26 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6661  ABC transporter related  36.44 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  36.72 
 
 		 349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4579  ABC transporter related  36.8 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381614 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  40.13 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  36.45 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  35.91 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  36.49 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  38.24 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>