More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1325 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  98.34 
 
 		 361 aa  729    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  88.92 
 
 		 361 aa  661    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  100 
 
 		 361 aa  738    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  77.53 
 
 		 367 aa  551  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  70.7 
 
 		 371 aa  515  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  62.46 
 
 		 356 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  62.15 
 
 		 356 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  63.46 
 
 		 358 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  60.28 
 
 		 356 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  62.6 
 
 		 364 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  64.67 
 
 		 360 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  60.23 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  60.57 
 
 		 357 aa  430  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  60 
 
 		 356 aa  421  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  61.02 
 
 		 366 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.05 
 
 		 365 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  56.51 
 
 		 365 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  56.2 
 
 		 365 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  55.92 
 
 		 365 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  54.87 
 
 		 370 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  59.32 
 
 		 367 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  58.77 
 
 		 365 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  58.92 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  56.2 
 
 		 365 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 371 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  55.99 
 
 		 371 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  58.47 
 
 		 367 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  58.5 
 
 		 365 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  54.19 
 
 		 359 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  58.31 
 
 		 367 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  58.29 
 
 		 365 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  57.75 
 
 		 356 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  54.97 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  52.05 
 
 		 384 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  52.89 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  55.21 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  55.9 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  53.93 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  60.19 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  55.77 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  51.94 
 
 		 362 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  52.21 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  59.22 
 
 		 358 aa  363  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  58.26 
 
 		 358 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  59.49 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  57.68 
 
 		 366 aa  359  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  56.76 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  52.17 
 
 		 365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  38.22 
 
 		 353 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  36.89 
 
 		 357 aa  222  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.79 
 
 		 349 aa  222  9e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5799  ABC transporter related protein  44.64 
 
 		 398 aa  219  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  39.33 
 
 		 353 aa  219  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  39.22 
 
 		 415 aa  219  7e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  36.99 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  38.86 
 
 		 372 aa  216  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.21 
 
 		 352 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  39.01 
 
 		 351 aa  215  9e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  35.26 
 
 		 365 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  40.65 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6133  ABC transporter related  35.01 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269314  normal  0.315029 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  37.5 
 
 		 352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6268  ABC transporter related  39.32 
 
 		 372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  37.99 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  43.18 
 
 		 364 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  40.86 
 
 		 370 aa  212  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  36.48 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  37.65 
 
 		 398 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  43.13 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  39.53 
 
 		 352 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  42.29 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.54 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  38.66 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  37.69 
 
 		 353 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  38.89 
 
 		 354 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.47 
 
 		 357 aa  210  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  43.06 
 
 		 358 aa  209  5e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.24 
 
 		 357 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.24 
 
 		 357 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.8 
 
 		 351 aa  209  7e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.8 
 
 		 351 aa  208  9e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  36.31 
 
 		 376 aa  208  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  42.36 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  35.07 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  38.31 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1699  ABC transporter related  38.44 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  36.56 
 
 		 353 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  40.14 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  38.07 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  37.38 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  37.1 
 
 		 370 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  38.76 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  37.88 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.19 
 
 		 365 aa  206  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  38.31 
 
 		 352 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  33.89 
 
 		 351 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  36.7 
 
 		 368 aa  205  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  37.9 
 
 		 350 aa  205  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  37.38 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>