More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4103 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  100 
 
 
371 aa  763    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  71.51 
 
 
367 aa  525  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  71.27 
 
 
361 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  70.7 
 
 
361 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  70.14 
 
 
361 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  63.61 
 
 
356 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  63.94 
 
 
356 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  64.41 
 
 
358 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  61.45 
 
 
356 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  62.89 
 
 
357 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  62.96 
 
 
360 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  62.71 
 
 
364 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  60.28 
 
 
356 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  59.38 
 
 
357 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  60.34 
 
 
366 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.54 
 
 
365 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  57.26 
 
 
365 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  57.63 
 
 
367 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  54.19 
 
 
359 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  59.29 
 
 
365 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  56.98 
 
 
365 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  57.63 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  59 
 
 
365 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  58.47 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  55.34 
 
 
365 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  58.76 
 
 
360 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  54.14 
 
 
366 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  53.42 
 
 
370 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  58.7 
 
 
365 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  53.8 
 
 
371 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  53.24 
 
 
371 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  58.38 
 
 
356 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  53.15 
 
 
384 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  55.43 
 
 
357 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  56.73 
 
 
365 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  53.46 
 
 
370 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  53.12 
 
 
369 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  56.55 
 
 
357 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  51.94 
 
 
362 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  55.22 
 
 
358 aa  364  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  57.85 
 
 
359 aa  363  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  53.16 
 
 
360 aa  360  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  58.44 
 
 
366 aa  358  7e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  55.72 
 
 
358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
373 aa  356  3.9999999999999996e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  56.74 
 
 
372 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  52.65 
 
 
356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  46.7 
 
 
365 aa  316  4e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  40.06 
 
 
357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.34 
 
 
352 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  38.67 
 
 
362 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  41.36 
 
 
352 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  42.19 
 
 
363 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  42.19 
 
 
363 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  38.08 
 
 
356 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  39.39 
 
 
356 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  37.77 
 
 
356 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  39.02 
 
 
357 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  34.78 
 
 
365 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  39.6 
 
 
368 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  35.04 
 
 
366 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  37.25 
 
 
379 aa  223  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  37.95 
 
 
426 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  40 
 
 
369 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  35.08 
 
 
370 aa  222  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  35.97 
 
 
402 aa  222  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  39.81 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  36.49 
 
 
357 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  39.81 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  40 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  34.16 
 
 
366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  39.38 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  37.57 
 
 
355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  34.16 
 
 
366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4984  ABC transporter related  39.62 
 
 
358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718795  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  42.27 
 
 
385 aa  220  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.85 
 
 
357 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  38.66 
 
 
349 aa  220  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  38.18 
 
 
359 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  37.24 
 
 
370 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  33.88 
 
 
366 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  33.9 
 
 
349 aa  219  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  36.58 
 
 
359 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  42.25 
 
 
357 aa  219  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  36.69 
 
 
370 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  33.88 
 
 
366 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  34.62 
 
 
366 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.84 
 
 
359 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  41.4 
 
 
363 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5863  ABC transporter related  37.58 
 
 
358 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0374119  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  40.6 
 
 
403 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  33.88 
 
 
366 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  40.19 
 
 
369 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  37.3 
 
 
349 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4324  ABC transporter-related protein  38.53 
 
 
361 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.935984 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 
366 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  33.88 
 
 
366 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  39.87 
 
 
370 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.75 
 
 
388 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  33.88 
 
 
366 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>