More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1206 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  89.2 
 
 
361 aa  664    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  88.92 
 
 
361 aa  661    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  100 
 
 
361 aa  736    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  78.93 
 
 
367 aa  567  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  71.27 
 
 
371 aa  518  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  62.08 
 
 
356 aa  454  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  61.84 
 
 
356 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  65.53 
 
 
360 aa  441  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  62.54 
 
 
358 aa  437  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  60.56 
 
 
364 aa  431  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  61.54 
 
 
357 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  60 
 
 
357 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  59.1 
 
 
356 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  60.56 
 
 
356 aa  418  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  59.33 
 
 
367 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  56.47 
 
 
365 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  59.28 
 
 
366 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  58.1 
 
 
360 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  55.92 
 
 
365 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  59.72 
 
 
356 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  58.77 
 
 
367 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  54.32 
 
 
359 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.94 
 
 
365 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  55.92 
 
 
365 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  58.5 
 
 
367 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  57.1 
 
 
365 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  54.42 
 
 
365 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  56.79 
 
 
365 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  53.2 
 
 
370 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  57.14 
 
 
365 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  51.5 
 
 
371 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  53.04 
 
 
371 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  55.77 
 
 
357 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  56.62 
 
 
357 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  51.09 
 
 
384 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  56.3 
 
 
358 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  54.28 
 
 
373 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  55.46 
 
 
360 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  52.62 
 
 
366 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  55.25 
 
 
370 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  55.49 
 
 
356 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  59.12 
 
 
359 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  55.31 
 
 
358 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  52.07 
 
 
362 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  58.64 
 
 
366 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  57.45 
 
 
372 aa  358  6e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  49.86 
 
 
369 aa  358  6e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  52.65 
 
 
365 aa  317  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  38.57 
 
 
357 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.89 
 
 
349 aa  236  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  37.14 
 
 
353 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  38.07 
 
 
359 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  39.07 
 
 
372 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  37.19 
 
 
353 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  36.84 
 
 
368 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  40.27 
 
 
361 aa  219  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  35.96 
 
 
353 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  34.99 
 
 
365 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  37.81 
 
 
368 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  36.77 
 
 
363 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.65 
 
 
356 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.65 
 
 
356 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.18 
 
 
352 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  40.82 
 
 
338 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  38.64 
 
 
352 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  37.43 
 
 
352 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.35 
 
 
356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.35 
 
 
356 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.35 
 
 
356 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  39.75 
 
 
353 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  38.01 
 
 
360 aa  215  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  36.86 
 
 
359 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  38.14 
 
 
362 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.3 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.3 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  37.36 
 
 
363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  43.98 
 
 
361 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  37.5 
 
 
351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  36.73 
 
 
371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5799  ABC transporter related protein  43.87 
 
 
398 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  44.23 
 
 
415 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.34 
 
 
351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.28 
 
 
357 aa  213  5.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  39.2 
 
 
366 aa  213  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  36.69 
 
 
368 aa  212  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  42.33 
 
 
398 aa  212  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  45.28 
 
 
374 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  39.66 
 
 
352 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  36.11 
 
 
356 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.17 
 
 
359 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.73 
 
 
357 aa  210  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  38.46 
 
 
385 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.99 
 
 
357 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.99 
 
 
357 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  38.22 
 
 
354 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  35.69 
 
 
355 aa  210  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.42 
 
 
356 aa  210  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  44.7 
 
 
416 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4187  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.69 
 
 
353 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  37.17 
 
 
359 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>