More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2223 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  100 
 
 		 360 aa  729    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  82.22 
 
 		 367 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  80.33 
 
 		 366 aa  590  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  80.33 
 
 		 367 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  78.61 
 
 		 367 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  65.46 
 
 		 360 aa  443  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  56.47 
 
 		 365 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  56.98 
 
 		 356 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  56.2 
 
 		 365 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  56.16 
 
 		 356 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  58.1 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  56.15 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  58.17 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  58.92 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  55.92 
 
 		 365 aa  398  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  58.07 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  58.76 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  57.51 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  57.78 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  56.94 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  57.63 
 
 		 367 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  53.48 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  56.39 
 
 		 358 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  55.52 
 
 		 364 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  56.39 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  54.04 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  56.11 
 
 		 358 aa  381  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  55.46 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  54.21 
 
 		 362 aa  381  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  53.17 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  64.73 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  60.83 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  55.28 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  53.33 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  50.95 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  54.23 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  59.56 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  51.79 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  55.72 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  50.55 
 
 		 365 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.93 
 
 		 365 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  55.09 
 
 		 365 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  50.68 
 
 		 370 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  52.05 
 
 		 365 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  50.96 
 
 		 371 aa  359  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  50.68 
 
 		 371 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  50.14 
 
 		 369 aa  351  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  47.53 
 
 		 365 aa  332  4e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  41.42 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  40.62 
 
 		 353 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  40 
 
 		 381 aa  246  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  39.2 
 
 		 357 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 398 aa  242  7.999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  40.53 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  41.37 
 
 		 374 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.89 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  38.67 
 
 		 370 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  44.37 
 
 		 357 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  36.91 
 
 		 389 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  44.52 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  43.69 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.63 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  41.43 
 
 		 359 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  41.51 
 
 		 361 aa  232  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  37.01 
 
 		 378 aa  232  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.91 
 
 		 349 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.46 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  37.5 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  36.64 
 
 		 372 aa  229  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  37.36 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.11 
 
 		 349 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.75 
 
 		 356 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  36.64 
 
 		 384 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  37.18 
 
 		 356 aa  226  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  35.54 
 
 		 386 aa  226  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  36.73 
 
 		 363 aa  226  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4187  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.7 
 
 		 353 aa  226  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  36.64 
 
 		 384 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.18 
 
 		 356 aa  225  9e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.18 
 
 		 356 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  37.18 
 
 		 356 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.83 
 
 		 349 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.18 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  39.58 
 
 		 360 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  37.18 
 
 		 356 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.18 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  37.53 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  38.95 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  36.89 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0235  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.18 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.18 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  37.85 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.18 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1654  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217926  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0350  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 397 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1743  ABC-type sugar transport systems, ATPase components  37.47 
 
 		 397 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0993542  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1236  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 397 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>