More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0385 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  100 
 
 		 357 aa  733    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  80.73 
 
 		 358 aa  601  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  82.02 
 
 		 356 aa  599  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  80.39 
 
 		 357 aa  598  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  77.09 
 
 		 359 aa  570  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  73.89 
 
 		 360 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  74.23 
 
 		 356 aa  542  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  72.07 
 
 		 358 aa  535  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  66.94 
 
 		 366 aa  502  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  64.59 
 
 		 372 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  61.98 
 
 		 365 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  62.81 
 
 		 365 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  61.71 
 
 		 365 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  57.34 
 
 		 362 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  56.2 
 
 		 370 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  56.94 
 
 		 359 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  58.92 
 
 		 357 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  59.07 
 
 		 366 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.82 
 
 		 365 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  54.55 
 
 		 365 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  58.17 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  54.27 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  57.46 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  57.46 
 
 		 367 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  56.63 
 
 		 367 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  57.23 
 
 		 365 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  56.25 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  51.61 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  56.68 
 
 		 356 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  55.43 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  52.78 
 
 		 366 aa  388  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  61.76 
 
 		 367 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  56.62 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  55.68 
 
 		 367 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  55.95 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  55.95 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  55.65 
 
 		 364 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  53.48 
 
 		 373 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  62.86 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  54.14 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  51.24 
 
 		 371 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  53.39 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  55.06 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  51.52 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  55.9 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  50.69 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  53.96 
 
 		 369 aa  368  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  50.29 
 
 		 365 aa  324  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  40.67 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  39.2 
 
 		 363 aa  241  1e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  39.76 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.88 
 
 		 352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  41.07 
 
 		 365 aa  239  4e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.79 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.2 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.41 
 
 		 349 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.79 
 
 		 356 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.4 
 
 		 359 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.48 
 
 		 356 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.48 
 
 		 356 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  43.28 
 
 		 365 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.39 
 
 		 349 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  39.51 
 
 		 359 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.48 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  40.85 
 
 		 386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  40.37 
 
 		 384 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  41.55 
 
 		 362 aa  235  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  40.37 
 
 		 384 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  39 
 
 		 357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  40.4 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  40.92 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.33 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  40.92 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.04 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.55 
 
 		 357 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3576  ABC transporter related  38.55 
 
 		 373 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  39.63 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  38.76 
 
 		 357 aa  233  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  39.45 
 
 		 384 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  40.92 
 
 		 348 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  41.94 
 
 		 367 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  41.94 
 
 		 367 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  41.01 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  40 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2712  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.46 
 
 		 363 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  38.58 
 
 		 403 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  40 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  45.69 
 
 		 357 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  40 
 
 		 385 aa  229  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  40.38 
 
 		 379 aa  229  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  39.69 
 
 		 381 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  40 
 
 		 332 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5875  ABC transporter related protein  42.01 
 
 		 351 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0109503  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  39.81 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  37.69 
 
 		 356 aa  229  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  44.94 
 
 		 353 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  44.94 
 
 		 353 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  38.62 
 
 		 358 aa  228  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>