More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4215 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  100 
 
 		 367 aa  741    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  85.83 
 
 		 367 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  92.64 
 
 		 367 aa  692    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  89.65 
 
 		 366 aa  671    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  80.33 
 
 		 360 aa  587  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  68.51 
 
 		 360 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  58.03 
 
 		 356 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  60.45 
 
 		 367 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  57.63 
 
 		 371 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  54.82 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  57.18 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  58.47 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  58.47 
 
 		 361 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  58.77 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  55.22 
 
 		 365 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  57.46 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  57.06 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  54.77 
 
 		 365 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  56.94 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  56.95 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  54.95 
 
 		 365 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  58.03 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  56.27 
 
 		 356 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  55.28 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  55.96 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  55.4 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  55.49 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  55.68 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  56.23 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  51.5 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  54.64 
 
 		 370 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  56.55 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 		 365 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  52.86 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  53.12 
 
 		 365 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  54.57 
 
 		 359 aa  368  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  61.44 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  51.79 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  51.91 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  55.92 
 
 		 365 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  58.61 
 
 		 373 aa  364  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  55.88 
 
 		 365 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  50 
 
 		 371 aa  358  9e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  48.92 
 
 		 370 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  59.38 
 
 		 372 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  49.87 
 
 		 371 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  51.79 
 
 		 369 aa  347  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  49.3 
 
 		 365 aa  334  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  41.64 
 
 		 374 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  44.88 
 
 		 356 aa  242  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  37.76 
 
 		 373 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.02 
 
 		 369 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  40.22 
 
 		 357 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  39 
 
 		 359 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  38.32 
 
 		 384 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  38.08 
 
 		 381 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.46 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  38.9 
 
 		 386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  40.75 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  36.81 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  39.17 
 
 		 359 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  39.67 
 
 		 357 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  42.19 
 
 		 359 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  40.28 
 
 		 398 aa  232  9e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  37.06 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  40.69 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  38.67 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  37.64 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  37.64 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  40.49 
 
 		 372 aa  229  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  37.64 
 
 		 379 aa  229  7e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  38.4 
 
 		 348 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  38.4 
 
 		 348 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  37.64 
 
 		 384 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  37.28 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2542  putative maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK  39.06 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  37.3 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  38.42 
 
 		 403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  40.18 
 
 		 367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  35.57 
 
 		 370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  40.18 
 
 		 367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  39.09 
 
 		 353 aa  225  8e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  39.52 
 
 		 332 aa  225  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  38.42 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  39.16 
 
 		 338 aa  225  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  40.85 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.3 
 
 		 369 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  40 
 
 		 365 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9197  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.88 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  38.55 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.14 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  40.3 
 
 		 363 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  38.12 
 
 		 415 aa  223  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  36.62 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 375 aa  223  3e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  39.34 
 
 		 356 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  36.12 
 
 		 355 aa  223  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  38.19 
 
 		 363 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  38.6 
 
 		 366 aa  222  6e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  39.22 
 
 		 332 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>