More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3739 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 371 aa  766    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  96.77 
 
 		 371 aa  744    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  83.47 
 
 		 370 aa  626  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  80 
 
 		 365 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  76.16 
 
 		 365 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  74.52 
 
 		 365 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  74.52 
 
 		 365 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  76.16 
 
 		 365 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  69.95 
 
 		 384 aa  532  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  67.85 
 
 		 369 aa  518  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  67.96 
 
 		 366 aa  509  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  56.91 
 
 		 359 aa  433  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  53.95 
 
 		 370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  56.23 
 
 		 365 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  55.28 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  53.85 
 
 		 361 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  54.32 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  54.62 
 
 		 356 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  55.12 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  53.8 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  54.85 
 
 		 365 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  53.31 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  51.5 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  53.48 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  54.14 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  52.86 
 
 		 367 aa  378  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  51.89 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  52.6 
 
 		 367 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  53.41 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  51.52 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  51.34 
 
 		 373 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  53.17 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  52.35 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  52.89 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  50.69 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  52.34 
 
 		 357 aa  364  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  53.28 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  51.9 
 
 		 364 aa  362  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  52.72 
 
 		 359 aa  359  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  50.96 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  49.46 
 
 		 367 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  51.79 
 
 		 358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  52.3 
 
 		 366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  50.69 
 
 		 356 aa  354  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  49.87 
 
 		 367 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  50.93 
 
 		 372 aa  352  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  49.86 
 
 		 358 aa  348  9e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  49.85 
 
 		 365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  38.91 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  39.53 
 
 		 379 aa  233  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  38.5 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1719  ABC transporter related  36.78 
 
 		 364 aa  229  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  37.79 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  42.02 
 
 		 356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.75 
 
 		 367 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0057  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.54 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  37.68 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.87 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  36.96 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  40.45 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  40.98 
 
 		 356 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  38.41 
 
 		 371 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.44 
 
 		 359 aa  222  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  38.41 
 
 		 371 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.97 
 
 		 365 aa  222  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  39.33 
 
 		 355 aa  222  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  36.8 
 
 		 367 aa  222  9e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  39.3 
 
 		 338 aa  222  9e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  36.8 
 
 		 367 aa  222  9e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.66 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  35.18 
 
 		 363 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  41.37 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.6 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.06 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  41.04 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  39.81 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  36.31 
 
 		 371 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  40.88 
 
 		 373 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.65 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3666  ABC transporter related  34.72 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  42.41 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.39 
 
 		 357 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.39 
 
 		 357 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4324  ABC transporter-related protein  40.8 
 
 		 361 aa  219  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.935984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  37.11 
 
 		 378 aa  219  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5678  ABC transporter related  37.14 
 
 		 365 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209131  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5686  ABC transporter related  37.8 
 
 		 377 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.661701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  36.52 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  40.14 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  37.22 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  35.73 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0094  ABC transporter related  37.8 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00776144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06937  sugar ABC transportor ATP-binding protein  35.48 
 
 		 364 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.71 
 
 		 352 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1391  ABC transporter related  39.3 
 
 		 362 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00218613  normal  0.166905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  39.17 
 
 		 355 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  36.17 
 
 		 359 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  38.11 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  41.81 
 
 		 352 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  37.35 
 
 		 349 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>