More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3129 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  100 
 
 		 357 aa  731    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  73.31 
 
 		 357 aa  530  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  61.54 
 
 		 361 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  60.57 
 
 		 361 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  60.29 
 
 		 361 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  57.14 
 
 		 356 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  60.51 
 
 		 367 aa  418  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  59.38 
 
 		 371 aa  416  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  57.14 
 
 		 356 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  60.73 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  57.3 
 
 		 358 aa  408  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  56.9 
 
 		 356 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  57.87 
 
 		 366 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  58.76 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  59.66 
 
 		 367 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  54.65 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  54.6 
 
 		 359 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  56.06 
 
 		 364 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  56.94 
 
 		 367 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  61.92 
 
 		 365 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  57.46 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  61.3 
 
 		 365 aa  391  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  57.51 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.24 
 
 		 365 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  56.94 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  58.24 
 
 		 365 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  58.6 
 
 		 365 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  58.24 
 
 		 365 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  58.43 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  60.62 
 
 		 365 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  53.46 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  54.12 
 
 		 365 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  57.1 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  54.44 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  55.65 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  54.44 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  57.06 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  55.65 
 
 		 358 aa  381  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  52.19 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  53.41 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  53.68 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  57.23 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  57.14 
 
 		 358 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  53.31 
 
 		 372 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  52.2 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  58.26 
 
 		 370 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  53.53 
 
 		 373 aa  363  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  48.75 
 
 		 365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  39.66 
 
 		 354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  40.37 
 
 		 353 aa  239  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  39.94 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  39.38 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  42.95 
 
 		 355 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  42.66 
 
 		 358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  41.14 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  38.58 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  42.21 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  40.24 
 
 		 357 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  38.64 
 
 		 355 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  40 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  38.03 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6367  ABC transporter related  39.89 
 
 		 371 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.114303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  37.68 
 
 		 355 aa  230  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  40.84 
 
 		 363 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.66 
 
 		 352 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  40.07 
 
 		 367 aa  229  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  38.35 
 
 		 355 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  45.71 
 
 		 356 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  37.02 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  38.24 
 
 		 354 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  37.29 
 
 		 384 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  39.23 
 
 		 359 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  40.68 
 
 		 353 aa  227  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  37.02 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5634  ABC transporter related  40.34 
 
 		 367 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.75 
 
 		 351 aa  226  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.85 
 
 		 359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  38.57 
 
 		 370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  39.09 
 
 		 361 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  41.96 
 
 		 355 aa  226  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  38.06 
 
 		 357 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.11 
 
 		 349 aa  225  8e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  39.93 
 
 		 345 aa  225  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  37.67 
 
 		 386 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  38.62 
 
 		 365 aa  225  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  37.83 
 
 		 370 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  41.1 
 
 		 356 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.55 
 
 		 349 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  37.02 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  38.51 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  36.74 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  43.12 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3722  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.71 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.55 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3752  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.71 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  38.28 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  43.12 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  42.6 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  38.53 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  36.2 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>