More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2043 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  100 
 
 		 365 aa  757    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  80 
 
 		 371 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  80 
 
 		 371 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  79.95 
 
 		 370 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  76.99 
 
 		 365 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  76.44 
 
 		 365 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  76.44 
 
 		 365 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  71.66 
 
 		 384 aa  546  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  75.07 
 
 		 365 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  71.47 
 
 		 369 aa  535  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  67.03 
 
 		 366 aa  494  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  56.59 
 
 		 359 aa  425  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  55.34 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  56.51 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  52.62 
 
 		 370 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  56.23 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  55.96 
 
 		 365 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  53.07 
 
 		 362 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  54.42 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  55.31 
 
 		 365 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  54.6 
 
 		 356 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  54.32 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  53.99 
 
 		 356 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  53.85 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  54.85 
 
 		 365 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  54.57 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  54.12 
 
 		 357 aa  383  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  53.72 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  55.65 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  52.62 
 
 		 366 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  55.25 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  54.27 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  53.78 
 
 		 367 aa  378  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  53.44 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  57.01 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  51.52 
 
 		 367 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  52.62 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  54.87 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  51.79 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  51.52 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  50.55 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  53.72 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  52.85 
 
 		 366 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  52.94 
 
 		 372 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  52.43 
 
 		 364 aa  356  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  51.92 
 
 		 358 aa  352  5e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  49.06 
 
 		 373 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  51.33 
 
 		 365 aa  333  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4324  ABC transporter-related protein  40.88 
 
 		 361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.935984 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  39.06 
 
 		 357 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.91 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.74 
 
 		 357 aa  230  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.47 
 
 		 357 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.47 
 
 		 357 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  38.48 
 
 		 357 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2849  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0912709 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  38.18 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  38.38 
 
 		 352 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  37.32 
 
 		 356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  38.48 
 
 		 357 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  37.8 
 
 		 379 aa  226  7e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  40.68 
 
 		 356 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  37.5 
 
 		 367 aa  225  8e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  37.5 
 
 		 367 aa  225  8e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  39.64 
 
 		 388 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  37.96 
 
 		 353 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  37.5 
 
 		 363 aa  225  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  41.58 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  38.44 
 
 		 355 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  39.16 
 
 		 373 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  38.55 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  35.85 
 
 		 353 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  39.88 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.26 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2080  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.65 
 
 		 378 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  36.49 
 
 		 371 aa  222  8e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  41.4 
 
 		 356 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3407  ABC transporter related  38.55 
 
 		 368 aa  222  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0057  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.6 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.71 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  38.6 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  39.94 
 
 		 391 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  39.27 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  35 
 
 		 364 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0408  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  35 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  35.26 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  41.78 
 
 		 356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  38.48 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  34.71 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  36.26 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5884  ABC transporter related  38.84 
 
 		 393 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6367  ABC transporter related  36.97 
 
 		 371 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.114303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.12 
 
 		 362 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.54 
 
 		 369 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  35 
 
 		 364 aa  219  6e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  37.22 
 
 		 357 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  38.44 
 
 		 371 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2542  putative maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK  38.33 
 
 		 366 aa  219  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5207  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.43 
 
 		 348 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.575313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>