More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0479 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  100 
 
 		 359 aa  733    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  77.93 
 
 		 358 aa  579  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  78.77 
 
 		 357 aa  571  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  77.09 
 
 		 357 aa  570  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  77.09 
 
 		 358 aa  558  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  76.19 
 
 		 356 aa  554  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  78.21 
 
 		 356 aa  555  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  73.33 
 
 		 360 aa  537  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  69.86 
 
 		 366 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  66.31 
 
 		 372 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  62.3 
 
 		 365 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  62.57 
 
 		 365 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  62.91 
 
 		 365 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  57.73 
 
 		 362 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  57.3 
 
 		 370 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  56.06 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  57.78 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  57.85 
 
 		 367 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  56.11 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  57.31 
 
 		 356 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  57.1 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  56.08 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.72 
 
 		 365 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  53.3 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  56.42 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  53.15 
 
 		 365 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  53.28 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  54.57 
 
 		 367 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  50.68 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  59.12 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  51.06 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  55.22 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  53.72 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  60.19 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  57.43 
 
 		 365 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  59.55 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  50.55 
 
 		 369 aa  363  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  54.33 
 
 		 356 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  57.68 
 
 		 367 aa  363  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  57.85 
 
 		 371 aa  363  4e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  53.55 
 
 		 371 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  53.46 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  62.18 
 
 		 360 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  52.72 
 
 		 371 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  53.24 
 
 		 370 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  53.13 
 
 		 356 aa  354  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  53.73 
 
 		 364 aa  354  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  49.28 
 
 		 365 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  41.18 
 
 		 359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  41.39 
 
 		 358 aa  219  7e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37 
 
 		 356 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  41.08 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37 
 
 		 356 aa  215  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37 
 
 		 356 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  38.02 
 
 		 360 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1719  ABC transporter related  36.05 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  37.35 
 
 		 368 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.34 
 
 		 356 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.7 
 
 		 356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  36.89 
 
 		 376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5875  ABC transporter related protein  39.69 
 
 		 351 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0109503  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  36.56 
 
 		 389 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.02 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  38.08 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  38.08 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  37.81 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1158  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.26 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.38 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.58 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.46 
 
 		 357 aa  210  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  36.99 
 
 		 367 aa  209  4e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.35 
 
 		 349 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  38.08 
 
 		 348 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  35.31 
 
 		 364 aa  209  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  39.82 
 
 		 393 aa  209  7e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  37 
 
 		 369 aa  209  7e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  36.45 
 
 		 366 aa  209  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  38.76 
 
 		 365 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  37.27 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  37.27 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  39.8 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  35.22 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.37 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  37.5 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  37.5 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  36.42 
 
 		 366 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.31 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  41.28 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  35.74 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  36.71 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7821  ABC transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  37.27 
 
 		 356 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.27 
 
 		 356 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.99 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  37.27 
 
 		 353 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  37.27 
 
 		 356 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  38.12 
 
 		 357 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.27 
 
 		 356 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>