More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4893 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  89.65 
 
 		 367 aa  671    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  87.19 
 
 		 367 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  100 
 
 		 366 aa  743    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  83.92 
 
 		 367 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  80.33 
 
 		 360 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  70.36 
 
 		 360 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  60.34 
 
 		 371 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  61.02 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  61.02 
 
 		 361 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  55.37 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  59.07 
 
 		 357 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  58.76 
 
 		 356 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  58.59 
 
 		 356 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  59.28 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  59.55 
 
 		 367 aa  401  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  56.63 
 
 		 365 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  56.44 
 
 		 365 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  56.63 
 
 		 365 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  57.87 
 
 		 357 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  60.64 
 
 		 356 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  56.44 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  57.63 
 
 		 357 aa  393  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  56.87 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  57.26 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  55.37 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  58.73 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  57.26 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  52.62 
 
 		 365 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  52.99 
 
 		 384 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  54.64 
 
 		 366 aa  378  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  58.01 
 
 		 356 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  53.97 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 		 365 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  51.89 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  56.85 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  57.18 
 
 		 358 aa  378  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  56.08 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  61.11 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  55.43 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  53.97 
 
 		 365 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  51.21 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  53.26 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  61.27 
 
 		 372 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  56.43 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  50.27 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  53.33 
 
 		 373 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  50.69 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  48.47 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  43.36 
 
 		 374 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  39.94 
 
 		 389 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  39.89 
 
 		 386 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.61 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  38.69 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  38.84 
 
 		 384 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  38.17 
 
 		 373 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  38.02 
 
 		 386 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  38.84 
 
 		 384 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  39.47 
 
 		 359 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  38.46 
 
 		 379 aa  236  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  39.94 
 
 		 353 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  38.84 
 
 		 384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.15 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  39.76 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  37.95 
 
 		 381 aa  234  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  38.48 
 
 		 356 aa  233  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  39.46 
 
 		 338 aa  233  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  38.27 
 
 		 348 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 		 375 aa  232  7.000000000000001e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  38.48 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  41.88 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  38.48 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  41.43 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  36.91 
 
 		 386 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.48 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.48 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.48 
 
 		 356 aa  230  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  40.7 
 
 		 367 aa  229  4e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.48 
 
 		 356 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  37.99 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  37.99 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  40.7 
 
 		 367 aa  229  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.22 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.13 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  37.68 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.48 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  42.63 
 
 		 357 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  39.7 
 
 		 366 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  41.72 
 
 		 356 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  36.62 
 
 		 370 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.18 
 
 		 356 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  38.35 
 
 		 357 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.48 
 
 		 356 aa  227  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.92 
 
 		 363 aa  226  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  38.87 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  38.44 
 
 		 358 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  40.91 
 
 		 367 aa  226  6e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  38.89 
 
 		 418 aa  226  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  40.21 
 
 		 367 aa  225  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1694  ABC transporter related  39.03 
 
 		 341 aa  225  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.923291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  40 
 
 		 345 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>