More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8440 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  61.1 
 
 		 687 aa  812    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 685 aa  1351    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  42.51 
 
 		 696 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  41.99 
 
 		 705 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  41.14 
 
 		 699 aa  451  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  39.83 
 
 		 703 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  39.83 
 
 		 703 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  41.47 
 
 		 708 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  43.47 
 
 		 603 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  36 
 
 		 711 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  32.51 
 
 		 712 aa  312  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.19 
 
 		 737 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  31.28 
 
 		 706 aa  295  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  41.01 
 
 		 679 aa  293  7e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.4 
 
 		 704 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  31.4 
 
 		 704 aa  289  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  31.4 
 
 		 704 aa  289  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  30.43 
 
 		 705 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  37.5 
 
 		 659 aa  270  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  33.14 
 
 		 714 aa  261  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  31.41 
 
 		 752 aa  238  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  31.33 
 
 		 737 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  31.68 
 
 		 759 aa  217  5.9999999999999996e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  32.56 
 
 		 716 aa  214  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  30.68 
 
 		 690 aa  203  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  31.73 
 
 		 696 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  26.33 
 
 		 683 aa  200  9e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  30.33 
 
 		 821 aa  196  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  31.05 
 
 		 662 aa  179  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  35.39 
 
 		 673 aa  173  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  29.86 
 
 		 717 aa  160  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  31.58 
 
 		 734 aa  132  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  24.7 
 
 		 819 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  28.83 
 
 		 697 aa  122  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  27.49 
 
 		 695 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  28.28 
 
 		 695 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  27.11 
 
 		 710 aa  107  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  28.96 
 
 		 712 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  28.46 
 
 		 700 aa  105  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  27.86 
 
 		 809 aa  100  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  28.27 
 
 		 663 aa  99  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  24.44 
 
 		 564 aa  99  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.75 
 
 		 1107 aa  95.1  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  27.43 
 
 		 508 aa  95.1  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  21.93 
 
 		 815 aa  92.8  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  26.45 
 
 		 685 aa  79.7  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  29.84 
 
 		 625 aa  78.2  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2134  DNA helicase IV  24.08 
 
 		 687 aa  77.8  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0277838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  28.07 
 
 		 708 aa  76.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  26.46 
 
 		 712 aa  75.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2692  DNA helicase IV  26.67 
 
 		 685 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  25.55 
 
 		 671 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  24.85 
 
 		 515 aa  75.1  0.000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0110  superfamily I DNA and RNA helicase  26.13 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.285644  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  26.3 
 
 		 1244 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  24.15 
 
 		 1127 aa  72.8  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.57 
 
 		 694 aa  72.4  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  27.14 
 
 		 682 aa  72  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  25.58 
 
 		 726 aa  70.1  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1033  DNA helicase IV  25.9 
 
 		 684 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0811314  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1150  DNA helicase IV  25.9 
 
 		 684 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1184  DNA helicase IV  26.06 
 
 		 684 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660138 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  27.09 
 
 		 593 aa  69.3  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1138  DNA helicase IV  25.85 
 
 		 684 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.06 
 
 		 710 aa  68.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.16 
 
 		 1089 aa  68.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1116  DNA helicase IV  25.85 
 
 		 684 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  27.08 
 
 		 700 aa  67.8  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  27.09 
 
 		 691 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  23.94 
 
 		 613 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0943  UvrD/REP helicase  31.9 
 
 		 684 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  28.08 
 
 		 710 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  32.56 
 
 		 845 aa  65.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  24.51 
 
 		 689 aa  65.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2544  DNA helicase IV  25.79 
 
 		 685 aa  65.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.057684  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1455  UvrD/REP helicase  20.38 
 
 		 715 aa  65.1  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  25.76 
 
 		 741 aa  65.1  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2625  DNA helicase IV  23.09 
 
 		 684 aa  65.1  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  28.17 
 
 		 1232 aa  65.1  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03620  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.84 
 
 		 640 aa  65.1  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2536  DNA helicase IV  23.09 
 
 		 684 aa  65.1  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000168244  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  25.48 
 
 		 699 aa  65.5  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1567  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.51 
 
 		 629 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  27.23 
 
 		 876 aa  64.7  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3204  DNA helicase IV  23.09 
 
 		 684 aa  64.3  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.0880304 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.82 
 
 		 802 aa  64.7  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2668  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.06 
 
 		 629 aa  64.7  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111087  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.93 
 
 		 658 aa  64.3  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1474  DNA helicase IV  24.42 
 
 		 684 aa  64.3  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.575734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2233  ATP-dependent DNA helicase  37.93 
 
 		 658 aa  64.3  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  25.66 
 
 		 619 aa  63.9  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  34.11 
 
 		 620 aa  63.9  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  26.19 
 
 		 1132 aa  63.9  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  29.12 
 
 		 612 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.55 
 
 		 689 aa  63.9  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  29.46 
 
 		 615 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4063  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  44.93 
 
 		 688 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.91 
 
 		 837 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1384  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  44.93 
 
 		 688 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00158737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1307  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  44.93 
 
 		 688 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000490806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>