More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1108 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  100 
 
 		 593 aa  1222    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  57.53 
 
 		 610 aa  687    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  56.64 
 
 		 601 aa  683    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  57.19 
 
 		 615 aa  687    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  52.69 
 
 		 619 aa  633  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  54.17 
 
 		 607 aa  628  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  50.41 
 
 		 612 aa  591  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  50.91 
 
 		 632 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  50.17 
 
 		 619 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  44.13 
 
 		 616 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  46.85 
 
 		 625 aa  494  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  40.99 
 
 		 613 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  38.1 
 
 		 616 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  38.2 
 
 		 615 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4277  DNA helicase II  42.29 
 
 		 314 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.260274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.53 
 
 		 607 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  27.92 
 
 		 593 aa  181  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  25.57 
 
 		 588 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  26.62 
 
 		 617 aa  118  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  25.83 
 
 		 617 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  24.06 
 
 		 568 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  31.91 
 
 		 697 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  31.94 
 
 		 708 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0738  hypothetical protein  27.52 
 
 		 631 aa  101  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  29.32 
 
 		 815 aa  100  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  32.56 
 
 		 712 aa  99.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  31.66 
 
 		 710 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  30.5 
 
 		 712 aa  96.3  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  25.51 
 
 		 574 aa  96.3  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  30.35 
 
 		 711 aa  95.1  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  25.7 
 
 		 673 aa  94.7  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  24.92 
 
 		 559 aa  94.4  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  28.69 
 
 		 703 aa  94.4  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  28.69 
 
 		 703 aa  94.4  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  21.8 
 
 		 827 aa  93.6  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  30.56 
 
 		 696 aa  91.7  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  26.01 
 
 		 579 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  28.69 
 
 		 695 aa  90.5  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  30.43 
 
 		 699 aa  89.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  30.12 
 
 		 706 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  28.8 
 
 		 663 aa  88.6  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.42 
 
 		 737 aa  87.8  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  29.84 
 
 		 734 aa  87.4  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  30.56 
 
 		 695 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  29.76 
 
 		 717 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  29.27 
 
 		 759 aa  85.9  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  31.23 
 
 		 690 aa  85.5  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  30.66 
 
 		 716 aa  84.7  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  27.03 
 
 		 819 aa  84.3  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  27.94 
 
 		 508 aa  84.3  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  28.8 
 
 		 752 aa  84.3  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  24.26 
 
 		 634 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  30.04 
 
 		 809 aa  81.6  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  28.91 
 
 		 705 aa  81.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 705 aa  80.1  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  28.69 
 
 		 714 aa  79  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3988  hypothetical protein  64.15 
 
 		 57 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00319492  normal  0.306977 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  29.04 
 
 		 662 aa  79  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  28.24 
 
 		 704 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  28.24 
 
 		 704 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.24 
 
 		 704 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1080  AAA ATPase  24.87 
 
 		 1136 aa  77.4  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  28.85 
 
 		 687 aa  77.4  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  26.76 
 
 		 554 aa  77.4  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.4 
 
 		 696 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  23.68 
 
 		 606 aa  73.9  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  27.56 
 
 		 679 aa  73.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  26.42 
 
 		 603 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  27.14 
 
 		 564 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  27.95 
 
 		 737 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  30.31 
 
 		 683 aa  72  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  24.43 
 
 		 671 aa  70.5  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1013  hypothetical protein  22.15 
 
 		 726 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0969  hypothetical protein  22.15 
 
 		 726 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  26.94 
 
 		 557 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  27.09 
 
 		 685 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  27.46 
 
 		 821 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  30.13 
 
 		 745 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  29.52 
 
 		 726 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  28.18 
 
 		 655 aa  66.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  28.89 
 
 		 726 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  28.89 
 
 		 725 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1281  hypothetical protein  27.78 
 
 		 554 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0983409  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4896  NERD domain protein  25.27 
 
 		 564 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0805838 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  27.08 
 
 		 646 aa  64.7  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1359  hypothetical protein  27.78 
 
 		 554 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0594  UvrD/REP helicase  27.46 
 
 		 676 aa  64.3  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2536  hypothetical protein  27.78 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1020  hypothetical protein  27.78 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44837  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0275  hypothetical protein  27.78 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985894  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0546  hypothetical protein  27.78 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.946495  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1296  hypothetical protein  27.78 
 
 		 669 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263973  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.09 
 
 		 767 aa  63.9  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  23.65 
 
 		 550 aa  63.5  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  26.46 
 
 		 705 aa  63.5  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  40.4 
 
 		 726 aa  63.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  27.56 
 
 		 700 aa  63.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1715  UvrD/REP helicase  26.87 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000356586  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  49.25 
 
 		 735 aa  61.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>