More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3757 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 695 aa  1418    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  46.08 
 
 		 710 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  46.12 
 
 		 697 aa  611  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  36.34 
 
 		 695 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  37.18 
 
 		 663 aa  357  5e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  34.69 
 
 		 712 aa  347  4e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  31.68 
 
 		 679 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.44 
 
 		 696 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  28.26 
 
 		 690 aa  167  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  28.85 
 
 		 716 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  30.65 
 
 		 708 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  29.88 
 
 		 705 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  28.24 
 
 		 703 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  28.24 
 
 		 703 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  25.38 
 
 		 706 aa  162  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  28 
 
 		 712 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  28.49 
 
 		 711 aa  160  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  30.55 
 
 		 696 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  25.9 
 
 		 819 aa  152  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  29.26 
 
 		 699 aa  150  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  29.76 
 
 		 687 aa  144  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  27.68 
 
 		 673 aa  143  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.21 
 
 		 704 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  25.79 
 
 		 705 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  26.02 
 
 		 704 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  28.15 
 
 		 662 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  26.02 
 
 		 704 aa  139  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.08 
 
 		 737 aa  138  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  29.94 
 
 		 809 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  29.39 
 
 		 603 aa  135  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  28.92 
 
 		 752 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  27.42 
 
 		 821 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  27.14 
 
 		 714 aa  126  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  24.61 
 
 		 815 aa  126  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  28.28 
 
 		 685 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  26.76 
 
 		 759 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  29.25 
 
 		 700 aa  120  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  29.22 
 
 		 734 aa  117  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  26.5 
 
 		 659 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  25 
 
 		 683 aa  114  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  26.06 
 
 		 737 aa  110  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  31.72 
 
 		 619 aa  97.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  26.48 
 
 		 717 aa  95.5  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  28.69 
 
 		 593 aa  90.5  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  24.84 
 
 		 671 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  32.95 
 
 		 615 aa  89.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  30.4 
 
 		 601 aa  87.8  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  29.02 
 
 		 612 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  30.62 
 
 		 610 aa  87  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  23.28 
 
 		 564 aa  87  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  30.2 
 
 		 607 aa  81.3  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.4 
 
 		 1107 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0116  hypothetical protein  28.48 
 
 		 335 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  26.17 
 
 		 724 aa  79.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  23.35 
 
 		 787 aa  73.9  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  26.44 
 
 		 742 aa  73.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  28.91 
 
 		 632 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  22.19 
 
 		 666 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  28.12 
 
 		 625 aa  71.2  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  22.68 
 
 		 749 aa  70.5  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  21.78 
 
 		 769 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  26.9 
 
 		 1232 aa  69.3  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.08 
 
 		 849 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.58 
 
 		 797 aa  68.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  26.5 
 
 		 797 aa  68.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  26.5 
 
 		 797 aa  68.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.86 
 
 		 662 aa  67  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  28.25 
 
 		 1032 aa  67  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  22.46 
 
 		 638 aa  67  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  24.93 
 
 		 735 aa  67  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.13 
 
 		 831 aa  67.4  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4007  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.33 
 
 		 673 aa  66.6  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00646067 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 		 741 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.94 
 
 		 670 aa  66.2  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0864  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.74 
 
 		 703 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0926772 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0723  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.13 
 
 		 896 aa  65.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363449  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  26.92 
 
 		 613 aa  65.1  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  23.77 
 
 		 764 aa  65.1  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2868  ATP-dependent DNA helicase Rep  38.95 
 
 		 665 aa  64.7  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00076  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.43 
 
 		 671 aa  65.1  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  25.29 
 
 		 768 aa  64.7  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.35 
 
 		 829 aa  64.7  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  36.13 
 
 		 706 aa  64.7  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  22.97 
 
 		 699 aa  64.3  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  22.8 
 
 		 689 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  24.4 
 
 		 689 aa  63.9  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0175  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.43 
 
 		 673 aa  63.9  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0305  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.33 
 
 		 670 aa  63.9  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4242  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.11 
 
 		 674 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.907548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4301  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.11 
 
 		 674 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165801  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  24.21 
 
 		 689 aa  63.9  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4139  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.11 
 
 		 674 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4193  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.11 
 
 		 674 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4038  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.43 
 
 		 673 aa  63.9  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0507  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.43 
 
 		 673 aa  63.9  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0177061  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  32.5 
 
 		 685 aa  63.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  24.21 
 
 		 689 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2731  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.89 
 
 		 665 aa  63.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  24.21 
 
 		 689 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  29.34 
 
 		 738 aa  63.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>