More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2859 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 690 aa  1408    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  61.69 
 
 		 716 aa  850    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  61.67 
 
 		 696 aa  861    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  38.7 
 
 		 673 aa  431  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  36.35 
 
 		 662 aa  395  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  34.55 
 
 		 706 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  33.01 
 
 		 712 aa  318  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  35.14 
 
 		 696 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  32.27 
 
 		 704 aa  302  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  32.27 
 
 		 704 aa  302  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.27 
 
 		 704 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  31.99 
 
 		 705 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  32.75 
 
 		 703 aa  297  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  32.75 
 
 		 703 aa  297  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  33.98 
 
 		 705 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  30.1 
 
 		 683 aa  273  8.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  30.76 
 
 		 752 aa  267  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  32.43 
 
 		 708 aa  262  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  32 
 
 		 699 aa  259  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  30.11 
 
 		 737 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  30.3 
 
 		 759 aa  240  6.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  30.51 
 
 		 714 aa  229  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  32.92 
 
 		 603 aa  227  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.55 
 
 		 737 aa  223  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  29.24 
 
 		 711 aa  219  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  33.75 
 
 		 679 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  33.39 
 
 		 659 aa  212  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  28.84 
 
 		 821 aa  210  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  30.68 
 
 		 685 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  29.44 
 
 		 687 aa  200  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  29.41 
 
 		 717 aa  197  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  34.12 
 
 		 734 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  29.74 
 
 		 712 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  29.92 
 
 		 697 aa  156  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  27.47 
 
 		 695 aa  154  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  30.48 
 
 		 809 aa  150  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  28.55 
 
 		 700 aa  146  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  26.52 
 
 		 710 aa  144  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  28.87 
 
 		 695 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.81 
 
 		 1107 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  30.71 
 
 		 663 aa  134  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  26.48 
 
 		 815 aa  131  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  23.48 
 
 		 819 aa  130  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  26.21 
 
 		 671 aa  94.4  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  24.24 
 
 		 564 aa  93.2  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  26.79 
 
 		 625 aa  90.5  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  31.23 
 
 		 593 aa  89.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  28.46 
 
 		 616 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  28.52 
 
 		 619 aa  84.3  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  24.19 
 
 		 699 aa  81.6  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  29.89 
 
 		 615 aa  81.3  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  26.97 
 
 		 613 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2914  hypothetical protein  24.42 
 
 		 658 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1549  hypothetical protein  39.07 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.400172  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  26.15 
 
 		 632 aa  74.3  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.98 
 
 		 772 aa  74.3  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  26.42 
 
 		 508 aa  73.2  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  27.13 
 
 		 612 aa  72  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  24.32 
 
 		 515 aa  72  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0116  hypothetical protein  26.75 
 
 		 335 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  26.98 
 
 		 601 aa  71.2  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 1421 aa  70.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  28.17 
 
 		 607 aa  70.1  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  24.63 
 
 		 588 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  26.34 
 
 		 1033 aa  67  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.88 
 
 		 743 aa  67  0.000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0209  UvrD/REP helicase  46.75 
 
 		 786 aa  64.3  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000644419  normal  0.953058 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  25.7 
 
 		 610 aa  64.3  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  27.86 
 
 		 619 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  21.04 
 
 		 714 aa  63.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1258  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44 
 
 		 864 aa  63.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.887597  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.52 
 
 		 689 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.28 
 
 		 704 aa  63.5  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0990  UvrD/REP helicase  22.79 
 
 		 674 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.771752  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  29.27 
 
 		 916 aa  62.4  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3362  UvrD family helicase  23.84 
 
 		 630 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.753608  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  26.02 
 
 		 702 aa  62  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  26.01 
 
 		 717 aa  61.2  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  24.55 
 
 		 712 aa  60.8  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  25.38 
 
 		 817 aa  61.2  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  26.44 
 
 		 785 aa  60.1  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  25.4 
 
 		 685 aa  59.7  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0110  superfamily I DNA and RNA helicase  25.17 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.285644  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  21.29 
 
 		 706 aa  59.3  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  23.1 
 
 		 722 aa  59.7  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  26.02 
 
 		 630 aa  60.1  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.13 
 
 		 710 aa  59.3  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.9 
 
 		 738 aa  58.9  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  25.58 
 
 		 616 aa  59.3  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  23.9 
 
 		 738 aa  58.5  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  30.28 
 
 		 666 aa  58.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.62 
 
 		 829 aa  57.4  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.62 
 
 		 699 aa  57.4  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1455  UvrD/REP helicase  22.08 
 
 		 715 aa  57  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  26.45 
 
 		 689 aa  57  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  21.49 
 
 		 689 aa  57  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  22.33 
 
 		 687 aa  56.6  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  18.91 
 
 		 1016 aa  57  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  25.46 
 
 		 710 aa  57  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  26.51 
 
 		 719 aa  57  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>