More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0589 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 663 aa  1330    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  37.18 
 
 		 695 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  37.32 
 
 		 710 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  36.3 
 
 		 697 aa  363  4e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  32.23 
 
 		 695 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  33.15 
 
 		 712 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  29.62 
 
 		 716 aa  165  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  31.66 
 
 		 809 aa  150  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 712 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.92 
 
 		 704 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  31.21 
 
 		 696 aa  146  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  26.75 
 
 		 704 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  30.29 
 
 		 673 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  26.75 
 
 		 704 aa  145  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  28.86 
 
 		 703 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  32.14 
 
 		 705 aa  145  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  30 
 
 		 690 aa  145  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  28.86 
 
 		 703 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  32.2 
 
 		 679 aa  143  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 		 705 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  33.33 
 
 		 711 aa  141  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.57 
 
 		 696 aa  141  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  26.26 
 
 		 706 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  30.51 
 
 		 662 aa  138  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  25.49 
 
 		 819 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  31.85 
 
 		 708 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  29.62 
 
 		 603 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.67 
 
 		 737 aa  131  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  28.78 
 
 		 699 aa  124  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  26.47 
 
 		 759 aa  123  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  25.44 
 
 		 683 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  28.9 
 
 		 734 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  28.85 
 
 		 717 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  28.09 
 
 		 700 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  28.93 
 
 		 737 aa  113  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  29.37 
 
 		 821 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  30.1 
 
 		 687 aa  112  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  28.49 
 
 		 659 aa  111  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  27.59 
 
 		 714 aa  107  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  28.27 
 
 		 752 aa  107  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  29.2 
 
 		 685 aa  105  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  24.12 
 
 		 815 aa  103  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  26.13 
 
 		 671 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  28.8 
 
 		 593 aa  92.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  30.43 
 
 		 612 aa  90.9  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  30.2 
 
 		 601 aa  89.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.99 
 
 		 1107 aa  87  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  31.09 
 
 		 619 aa  87  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  32 
 
 		 615 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  26.54 
 
 		 780 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1135  hypothetical protein  27.31 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0285416  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  25.49 
 
 		 768 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5127  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.39 
 
 		 932 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  29.6 
 
 		 607 aa  81.3  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  27.97 
 
 		 778 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  27.86 
 
 		 776 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  27.97 
 
 		 776 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  27.97 
 
 		 777 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  27.97 
 
 		 776 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  26.92 
 
 		 777 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  26.54 
 
 		 776 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  31.64 
 
 		 619 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2565  ankyrin  26.78 
 
 		 973 aa  74.3  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00388007  normal  0.0998723 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  22.64 
 
 		 564 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  27.2 
 
 		 777 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  28.91 
 
 		 778 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 		 1421 aa  71.2  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  41.38 
 
 		 721 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  29.02 
 
 		 610 aa  70.5  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  26.32 
 
 		 588 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  26.85 
 
 		 762 aa  68.6  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  28.78 
 
 		 737 aa  68.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  40.16 
 
 		 724 aa  67.8  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.43 
 
 		 694 aa  67.8  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  40.16 
 
 		 724 aa  67.4  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1058  hypothetical protein  28.63 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0139648 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  45.45 
 
 		 723 aa  67.4  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.21 
 
 		 662 aa  67  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0490  UvrD/REP helicase family protein  25.48 
 
 		 890 aa  66.2  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  26.97 
 
 		 632 aa  66.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  42.2 
 
 		 719 aa  65.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0070  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.4 
 
 		 671 aa  65.1  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  40.2 
 
 		 719 aa  65.1  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1080  AAA ATPase  26.23 
 
 		 1136 aa  64.7  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  38.54 
 
 		 724 aa  65.1  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00076  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.48 
 
 		 671 aa  64.7  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  38.79 
 
 		 666 aa  64.3  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  40.43 
 
 		 727 aa  64.7  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  32.79 
 
 		 685 aa  64.3  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  40.62 
 
 		 720 aa  64.3  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  23.87 
 
 		 946 aa  63.9  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  23.87 
 
 		 946 aa  63.9  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  39.45 
 
 		 720 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  40.43 
 
 		 721 aa  63.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2914  hypothetical protein  24.46 
 
 		 658 aa  63.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  38.54 
 
 		 734 aa  63.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  40.43 
 
 		 721 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  24.32 
 
 		 738 aa  63.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  39.45 
 
 		 720 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  40.62 
 
 		 720 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>