More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2914 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2914  hypothetical protein  100 
 
 		 658 aa  1362    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2531  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  41.19 
 
 		 636 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2668  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.08 
 
 		 629 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1567  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.85 
 
 		 629 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0878  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.1 
 
 		 704 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0874  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.1 
 
 		 704 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0827  superfamily I DNA/RNA helicase  27.77 
 
 		 737 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0864  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.04 
 
 		 703 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0926772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0025  UvrD/Rep helicase family protein  27.92 
 
 		 852 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.39 
 
 		 763 aa  95.9  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.39 
 
 		 763 aa  95.1  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  28.75 
 
 		 702 aa  92  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  24.08 
 
 		 819 aa  91.3  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  24.06 
 
 		 564 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  31.68 
 
 		 703 aa  84.3  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  24.47 
 
 		 708 aa  84.3  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  26.64 
 
 		 762 aa  83.2  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1135  hypothetical protein  27.27 
 
 		 269 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0285416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  30.09 
 
 		 691 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  27.27 
 
 		 778 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  30.09 
 
 		 691 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  31.05 
 
 		 755 aa  81.3  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  29.52 
 
 		 689 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  31.75 
 
 		 689 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  31.75 
 
 		 691 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  31.22 
 
 		 689 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  31.22 
 
 		 689 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  31.22 
 
 		 689 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  31.22 
 
 		 689 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  27.44 
 
 		 787 aa  78.2  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.88 
 
 		 738 aa  77.8  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  31.22 
 
 		 689 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  26.88 
 
 		 738 aa  77  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  28.18 
 
 		 764 aa  77  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  27.72 
 
 		 702 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  28.71 
 
 		 712 aa  75.1  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  25.81 
 
 		 673 aa  75.1  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  27.82 
 
 		 738 aa  74.7  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  27.27 
 
 		 777 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  26.82 
 
 		 776 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  27.78 
 
 		 735 aa  73.9  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  26.75 
 
 		 778 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  25.46 
 
 		 745 aa  73.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  24.51 
 
 		 508 aa  73.9  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  27.76 
 
 		 739 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  25.66 
 
 		 768 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  27.27 
 
 		 777 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  28.8 
 
 		 753 aa  72.4  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  26.62 
 
 		 725 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  28.06 
 
 		 739 aa  72.8  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  26.62 
 
 		 726 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  27.6 
 
 		 776 aa  72  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  27.47 
 
 		 780 aa  72  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  26.32 
 
 		 777 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  24.41 
 
 		 711 aa  72  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  27.6 
 
 		 776 aa  72  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  28.51 
 
 		 776 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  26.16 
 
 		 746 aa  71.6  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  26.3 
 
 		 726 aa  71.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  28.37 
 
 		 785 aa  72  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  24.64 
 
 		 726 aa  70.9  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  24.03 
 
 		 737 aa  70.5  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.09 
 
 		 710 aa  69.7  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  25.97 
 
 		 743 aa  70.5  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  28.11 
 
 		 760 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  24.42 
 
 		 690 aa  70.5  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  23.27 
 
 		 701 aa  69.7  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.08 
 
 		 743 aa  69.7  0.0000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  27.4 
 
 		 744 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  26.18 
 
 		 726 aa  68.9  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  25.98 
 
 		 725 aa  68.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.87 
 
 		 751 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  24.54 
 
 		 717 aa  68.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  24.05 
 
 		 668 aa  68.2  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  25.48 
 
 		 705 aa  68.2  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.63 
 
 		 706 aa  68.2  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  24.19 
 
 		 716 aa  67.8  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  23.75 
 
 		 666 aa  67.8  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  26.13 
 
 		 680 aa  67.8  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  29.44 
 
 		 742 aa  67.4  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  23.86 
 
 		 722 aa  67.4  0.0000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  24.58 
 
 		 787 aa  67.4  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  24.35 
 
 		 703 aa  67.4  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.6 
 
 		 694 aa  67.4  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.12 
 
 		 751 aa  67.4  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  26.8 
 
 		 741 aa  67.4  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  24.35 
 
 		 703 aa  67.4  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  26.53 
 
 		 662 aa  67.4  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.86 
 
 		 858 aa  66.6  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.8 
 
 		 742 aa  67  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.5 
 
 		 804 aa  67  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  28.44 
 
 		 706 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  28.57 
 
 		 717 aa  67  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  25.07 
 
 		 762 aa  67  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1455  UvrD/REP helicase  24.32 
 
 		 715 aa  65.9  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  29.73 
 
 		 684 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.36 
 
 		 711 aa  66.2  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2092  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.91 
 
 		 783 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0227682  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  23.08 
 
 		 681 aa  65.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0766  UvrD/REP helicase  25.91 
 
 		 786 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>