61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1058 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1058  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  823    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0139648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  25.19 
 
 		 616 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  25.99 
 
 		 632 aa  66.2  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  25 
 
 		 601 aa  63.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  28.23 
 
 		 574 aa  62.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  27.42 
 
 		 663 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  26.7 
 
 		 568 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  25.51 
 
 		 702 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  24.82 
 
 		 711 aa  58.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  23.91 
 
 		 616 aa  57  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  24.03 
 
 		 708 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  23.46 
 
 		 619 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  23.81 
 
 		 717 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  26.42 
 
 		 610 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  25 
 
 		 698 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  23.87 
 
 		 615 aa  54.7  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  26.62 
 
 		 695 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  25 
 
 		 613 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  24.36 
 
 		 780 aa  53.1  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0864  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.36 
 
 		 703 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0926772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25 
 
 		 672 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  23.31 
 
 		 607 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  24.03 
 
 		 712 aa  51.6  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  24.35 
 
 		 689 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  24.35 
 
 		 689 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  24.35 
 
 		 689 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.7 
 
 		 706 aa  50.4  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  24.2 
 
 		 625 aa  50.4  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  24.35 
 
 		 689 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.53 
 
 		 659 aa  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  21.96 
 
 		 612 aa  49.7  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  22.52 
 
 		 615 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.21 
 
 		 732 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  24.07 
 
 		 579 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  26.27 
 
 		 710 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  23.91 
 
 		 689 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0351  hypothetical protein  22.43 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0328547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  22.89 
 
 		 691 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5216  superfamily I DNA/RNA helicase  24.08 
 
 		 722 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.1 
 
 		 716 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  23.06 
 
 		 619 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  25.5 
 
 		 702 aa  47.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  23.32 
 
 		 593 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  21.31 
 
 		 691 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  52.38 
 
 		 710 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  23.91 
 
 		 689 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  25.21 
 
 		 755 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  25.1 
 
 		 593 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  22.09 
 
 		 691 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2914  hypothetical protein  24.39 
 
 		 658 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  25.94 
 
 		 787 aa  44.3  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  23.14 
 
 		 768 aa  44.3  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  41.1 
 
 		 697 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  23.91 
 
 		 689 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  24.6 
 
 		 706 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  24.6 
 
 		 706 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0360  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  21.69 
 
 		 736 aa  43.5  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  21.09 
 
 		 696 aa  43.5  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  23.66 
 
 		 564 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  23.24 
 
 		 617 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  26.19 
 
 		 673 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>