More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4897 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 705 aa  1464    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  93.03 
 
 		 704 aa  1376    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  93.17 
 
 		 704 aa  1377    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  48.65 
 
 		 706 aa  647    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  50.49 
 
 		 712 aa  694    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  92.75 
 
 		 704 aa  1372    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  36.34 
 
 		 696 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  37.09 
 
 		 703 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  37.09 
 
 		 703 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  35.77 
 
 		 705 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  34.81 
 
 		 708 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  34.08 
 
 		 699 aa  364  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  32.91 
 
 		 683 aa  343  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  31.15 
 
 		 714 aa  318  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.58 
 
 		 737 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  31.52 
 
 		 737 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  31.99 
 
 		 690 aa  293  9e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  30.14 
 
 		 711 aa  290  4e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  34.88 
 
 		 659 aa  290  8e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  32.23 
 
 		 696 aa  286  5.999999999999999e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  31.24 
 
 		 673 aa  286  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  31.28 
 
 		 716 aa  285  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  30.43 
 
 		 685 aa  284  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  29.63 
 
 		 821 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  30.45 
 
 		 752 aa  279  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  30.08 
 
 		 687 aa  276  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  30.06 
 
 		 717 aa  254  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  30.21 
 
 		 662 aa  250  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  32.85 
 
 		 603 aa  237  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  33.33 
 
 		 679 aa  228  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  28.05 
 
 		 759 aa  227  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  29.83 
 
 		 700 aa  206  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  30.64 
 
 		 809 aa  200  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  28.02 
 
 		 734 aa  177  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  28.74 
 
 		 697 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  27.36 
 
 		 710 aa  138  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  26.17 
 
 		 695 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  27.05 
 
 		 712 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  23.15 
 
 		 819 aa  129  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  26.49 
 
 		 663 aa  127  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  25.79 
 
 		 695 aa  123  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.5 
 
 		 1107 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  25.78 
 
 		 671 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  25.24 
 
 		 815 aa  106  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  22.77 
 
 		 564 aa  99  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  25.27 
 
 		 508 aa  92.8  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  29.43 
 
 		 625 aa  90.9  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  28.2 
 
 		 619 aa  83.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1549  hypothetical protein  30.1 
 
 		 465 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.400172  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  28.91 
 
 		 593 aa  81.3  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  28.46 
 
 		 615 aa  79  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4063  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  25.33 
 
 		 688 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1279  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  25.07 
 
 		 688 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  28.98 
 
 		 601 aa  76.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3362  UvrD family helicase  22.75 
 
 		 630 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.753608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.98 
 
 		 694 aa  76.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1127  ATP-dependent DNA helicase  25.53 
 
 		 688 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1120  ATP-dependent DNA helicase  25.53 
 
 		 688 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  26.25 
 
 		 632 aa  75.1  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  24.35 
 
 		 758 aa  75.1  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1346  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.53 
 
 		 688 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1307  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  25.53 
 
 		 688 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000490806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  28.42 
 
 		 787 aa  74.3  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1239  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.53 
 
 		 657 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1384  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  25.53 
 
 		 688 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00158737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1146  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.53 
 
 		 688 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36032  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0116  hypothetical protein  25.6 
 
 		 335 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.19 
 
 		 742 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  25.62 
 
 		 739 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  24.29 
 
 		 744 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  26.22 
 
 		 727 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3651  UvrD/REP helicase  25.19 
 
 		 641 aa  72.4  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00677749  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  25.8 
 
 		 682 aa  72  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0943  UvrD/REP helicase  25.13 
 
 		 684 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  24.87 
 
 		 749 aa  71.6  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1133  UvrD/REP helicase  24.53 
 
 		 688 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  24.93 
 
 		 742 aa  70.9  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  27.97 
 
 		 619 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 1421 aa  70.9  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  26.29 
 
 		 727 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  26.58 
 
 		 702 aa  70.1  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  26.63 
 
 		 728 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.52 
 
 		 802 aa  70.1  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.75 
 
 		 710 aa  70.1  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.61 
 
 		 738 aa  69.7  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  29.12 
 
 		 722 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  28.67 
 
 		 721 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.75 
 
 		 754 aa  69.3  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  24.74 
 
 		 717 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  29.12 
 
 		 722 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  28.85 
 
 		 722 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  26.63 
 
 		 728 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  25.06 
 
 		 732 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  25.25 
 
 		 707 aa  69.3  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  29.12 
 
 		 722 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  24.12 
 
 		 769 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  24.61 
 
 		 738 aa  69.7  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  24.68 
 
 		 1244 aa  68.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  28.67 
 
 		 722 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.03 
 
 		 833 aa  69.3  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>