More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1352 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  55.73 
 
 		 706 aa  786    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  50.56 
 
 		 704 aa  702    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  50.42 
 
 		 704 aa  701    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  50.42 
 
 		 705 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 712 aa  1476    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  50.42 
 
 		 704 aa  701    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  37.08 
 
 		 696 aa  433  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  38.16 
 
 		 703 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  38.16 
 
 		 703 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  36.64 
 
 		 705 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  33.94 
 
 		 699 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  35.18 
 
 		 683 aa  395  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.1 
 
 		 737 aa  352  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  31.81 
 
 		 714 aa  347  4e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  34.9 
 
 		 708 aa  343  7e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  33.47 
 
 		 696 aa  332  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  30.92 
 
 		 716 aa  326  7e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  33.01 
 
 		 690 aa  324  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  35.92 
 
 		 659 aa  320  7.999999999999999e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  32.51 
 
 		 685 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  33.02 
 
 		 752 aa  317  5e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  31.19 
 
 		 821 aa  300  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  30.51 
 
 		 711 aa  292  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  30.84 
 
 		 687 aa  284  5.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  29.56 
 
 		 673 aa  276  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  30.33 
 
 		 759 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  30.41 
 
 		 737 aa  267  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  28.94 
 
 		 662 aa  264  4.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  29.71 
 
 		 717 aa  258  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  32.51 
 
 		 603 aa  249  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  30.75 
 
 		 679 aa  219  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  30.52 
 
 		 700 aa  207  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  31.46 
 
 		 809 aa  195  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  29.65 
 
 		 734 aa  185  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  25.05 
 
 		 819 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  29.55 
 
 		 712 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  28 
 
 		 695 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  27.1 
 
 		 697 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  26.25 
 
 		 695 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  26.68 
 
 		 710 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  27.06 
 
 		 815 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  28.23 
 
 		 663 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.27 
 
 		 1107 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  29.77 
 
 		 625 aa  100  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  32.56 
 
 		 593 aa  99.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 		 671 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  26.34 
 
 		 508 aa  93.6  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1549  hypothetical protein  29.43 
 
 		 465 aa  92  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.400172  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  30.77 
 
 		 619 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  23.25 
 
 		 564 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  24.93 
 
 		 807 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1279  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  25.53 
 
 		 688 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456815  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  22.59 
 
 		 699 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  26.62 
 
 		 615 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  27.65 
 
 		 1032 aa  79  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4063  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  24.76 
 
 		 688 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  26.24 
 
 		 632 aa  78.6  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1127  ATP-dependent DNA helicase  25.27 
 
 		 688 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1239  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.27 
 
 		 657 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1146  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.27 
 
 		 688 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1120  ATP-dependent DNA helicase  25.27 
 
 		 688 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1384  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  25.27 
 
 		 688 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00158737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1346  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25 
 
 		 688 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  25.56 
 
 		 601 aa  74.7  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  26.24 
 
 		 616 aa  74.3  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1307  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  24.73 
 
 		 688 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000490806 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  24.81 
 
 		 612 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.1 
 
 		 754 aa  68.2  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1133  UvrD/REP helicase  24.47 
 
 		 688 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  25 
 
 		 710 aa  67.4  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  25 
 
 		 619 aa  67.4  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0943  UvrD/REP helicase  23.22 
 
 		 684 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  23.31 
 
 		 689 aa  65.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 1421 aa  65.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  21.62 
 
 		 722 aa  64.7  0.000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.29 
 
 		 833 aa  64.3  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  24.91 
 
 		 613 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0776  UvrD/REP helicase  29.33 
 
 		 1143 aa  63.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  22.25 
 
 		 659 aa  63.9  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0116  hypothetical protein  26.57 
 
 		 335 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.37 
 
 		 748 aa  62.8  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000320  DNA helicase IV  22.6 
 
 		 689 aa  62  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.06 
 
 		 772 aa  62.4  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  25.35 
 
 		 723 aa  61.6  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  24.43 
 
 		 616 aa  60.8  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.82 
 
 		 794 aa  60.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  23.8 
 
 		 731 aa  60.1  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  26.64 
 
 		 751 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1050  UvrD/REP helicase  24.07 
 
 		 597 aa  60.5  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  37.5 
 
 		 674 aa  60.1  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  23.64 
 
 		 607 aa  60.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.35 
 
 		 673 aa  60.1  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 763 aa  59.3  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  25.54 
 
 		 726 aa  59.3  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  21 
 
 		 723 aa  58.9  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.32 
 
 		 785 aa  58.9  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  23.51 
 
 		 610 aa  58.9  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  38.46 
 
 		 657 aa  58.9  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  25.47 
 
 		 771 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0754  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.47 
 
 		 587 aa  58.2  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.643559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>