More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1419 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  100 
 
 
706 aa  1449    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  49.01 
 
 
704 aa  653    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  48.65 
 
 
705 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  49.01 
 
 
704 aa  654    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  55.73 
 
 
712 aa  782    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  49.01 
 
 
704 aa  653    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  36.06 
 
 
696 aa  411  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  35.98 
 
 
703 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  35.98 
 
 
703 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  35.24 
 
 
683 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  34.72 
 
 
705 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  33.05 
 
 
699 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.29 
 
 
737 aa  352  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  33.98 
 
 
716 aa  342  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  31.83 
 
 
714 aa  334  4e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  32.78 
 
 
708 aa  332  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  34.55 
 
 
690 aa  330  6e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  33.57 
 
 
696 aa  324  4e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  35.52 
 
 
659 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  30.54 
 
 
711 aa  296  9e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  31.28 
 
 
685 aa  295  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  30.56 
 
 
687 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  32.26 
 
 
662 aa  278  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  30.66 
 
 
821 aa  276  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  33.11 
 
 
752 aa  273  8.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  35.26 
 
 
603 aa  262  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  31.48 
 
 
759 aa  261  4e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  29.22 
 
 
673 aa  244  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  30.92 
 
 
737 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  33.61 
 
 
679 aa  230  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  29.65 
 
 
717 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  32.34 
 
 
700 aa  225  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  30.83 
 
 
809 aa  195  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  29.04 
 
 
734 aa  178  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  25.65 
 
 
819 aa  174  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  28.8 
 
 
712 aa  165  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  28.04 
 
 
697 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  25.38 
 
 
695 aa  144  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  27.56 
 
 
710 aa  141  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  25 
 
 
815 aa  131  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  25.09 
 
 
695 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.19 
 
 
1107 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  25.97 
 
 
663 aa  124  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  30.04 
 
 
619 aa  98.6  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  25.27 
 
 
671 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  30.12 
 
 
593 aa  89.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0116  hypothetical protein  27.93 
 
 
335 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1549  hypothetical protein  39.47 
 
 
465 aa  82  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.400172  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  26.94 
 
 
508 aa  81.3  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  28.23 
 
 
613 aa  80.9  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  28.79 
 
 
615 aa  80.9  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1127  ATP-dependent DNA helicase  25.54 
 
 
688 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1346  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.54 
 
 
688 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  23.26 
 
 
564 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  29.59 
 
 
601 aa  79.7  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1146  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.54 
 
 
688 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1120  ATP-dependent DNA helicase  25.54 
 
 
688 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1384  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  25.54 
 
 
688 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00158737  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1279  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  25.54 
 
 
688 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1307  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  25.54 
 
 
688 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000490806 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  25.77 
 
 
616 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.23 
 
 
710 aa  78.2  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  28.89 
 
 
612 aa  77.8  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  29.55 
 
 
632 aa  77.4  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0943  UvrD/REP helicase  25.53 
 
 
684 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4063  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  25.54 
 
 
688 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141871  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  26.57 
 
 
610 aa  74.3  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1133  UvrD/REP helicase  26.6 
 
 
688 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  25.71 
 
 
1033 aa  74.3  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1239  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.22 
 
 
657 aa  74.3  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  23.98 
 
 
689 aa  73.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2134  DNA helicase IV  23.91 
 
 
687 aa  73.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0277838  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  28.11 
 
 
625 aa  72.8  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  32.58 
 
 
702 aa  70.5  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  28.77 
 
 
619 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.14 
 
 
704 aa  70.1  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.33 
 
 
709 aa  69.7  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2353  DNA helicase IV  22.85 
 
 
684 aa  67.8  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757014  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  27.43 
 
 
719 aa  67.8  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 
715 aa  67.4  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06510  ATP-dependent DNA helicase pcra, putative  23.72 
 
 
982 aa  67.4  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0025  UvrD/Rep helicase family protein  25 
 
 
852 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  27.2 
 
 
682 aa  67  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.08 
 
 
849 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00966  DNA helicase IV  22.66 
 
 
684 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0970992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2681  UvrD/REP helicase  22.66 
 
 
684 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  27.61 
 
 
719 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00973  hypothetical protein  22.66 
 
 
684 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132374  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1455  UvrD/REP helicase  23.4 
 
 
715 aa  66.2  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1071  DNA helicase IV  22.66 
 
 
684 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3362  UvrD family helicase  24.72 
 
 
630 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.753608  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1126  DNA helicase IV  22.46 
 
 
684 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440253  normal  0.367013 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2157  DNA helicase IV  22.66 
 
 
684 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00794949  normal  0.209046 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1077  DNA helicase IV  22.66 
 
 
684 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255278  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  26.32 
 
 
876 aa  65.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  21.63 
 
 
699 aa  65.1  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  24.93 
 
 
807 aa  64.7  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1138  DNA helicase IV  24.09 
 
 
684 aa  64.3  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  25.19 
 
 
616 aa  64.3  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  28.04 
 
 
697 aa  64.3  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>