More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2635 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2635  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.136197 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2355  transcriptional regulator, LysR family  68.58 
 
 		 300 aa  435  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2629  transcriptional regulator, LysR family  68.24 
 
 		 300 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1712  transcriptional regulator, LysR family  67.23 
 
 		 298 aa  427  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00729088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5405  transcriptional regulator, LysR family  37.72 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4944  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.37 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5919  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 306 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0281  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 295 aa  191  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4601  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180418  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4130  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 295 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1288  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.442115 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03700  Transcriptional regulator, LysR-family  35.81 
 
 		 296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.207536  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3909  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68420  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 306 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.244196  normal  0.506187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2149  LysR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000094  Transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4560  LysR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2729  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0987  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0626  LysR, substrate-binding  36.36 
 
 		 318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0259  transcriptional regulator, LysR family  31.77 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2859  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0203947  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2350  LysR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1874  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.780478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2856  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 294 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.73032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0727  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0842  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.875433  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4648  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 297 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2900  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3482  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.532099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3092  LysR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0749  transcriptional regulator, LysR family protein  32.14 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1077  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 296 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.337774  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4408  LysR substrate-binding  30.23 
 
 		 311 aa  135  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2738  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.154223  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3639  transcriptional regulator, LysR family  31.73 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.958787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0802  transcriptional regulator, LysR family  35.06 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4871  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0284682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3928  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4916  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 311 aa  132  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4918  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10118  oxidative stress response regulatory protein oxyS  30.67 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3577  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.995392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7619  transcriptional regulator, LysR family  32.95 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0262862  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3197  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2713  transcriptional regulator, LysR family  32.95 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4101  transcriptional regulator LysR family  30.52 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0491587  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8356  transcriptional regulator, LysR family  29.7 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0404  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2595  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2452  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4031  LysR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  0.632902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4074  transcriptional regulator, LysR family  31.28 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1847  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3700  transcriptional regulator, LysR family  30.52 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2753  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 320 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.097787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0823  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2561  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 297 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0506375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1650  transcriptional regulator, LysR family  28.92 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.47658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1476  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2387  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3778  transcriptional regulator, LysR family  28.86 
 
 		 336 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0954002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0115  transcriptional regulator, LysR family  35.22 
 
 		 313 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3192  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0963  LysR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 304 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2780  transcriptional regulator, LysR family  38.93 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967057  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  30.52 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3234  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.86 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.842433  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 328 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 328 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  27.38 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2788  LysR, substrate-binding  37.06 
 
 		 301 aa  89  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1769  LysR family transcriptional regulator  22.74 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0244764  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2176  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 299 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1375  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58375  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  30.45 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2378  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0835  LysR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 364 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.643048  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2510  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 317 aa  87  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1139  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000235154  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1181  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00113734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3132  transcriptional regulator, LysR family  34.97 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000319195  normal  0.475584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1225  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00128193  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1258  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000142134  normal  0.057719 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1328  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 304 aa  86.3  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2948  transcriptional regulator, LysR family protein  32.37 
 
 		 305 aa  85.9  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.190207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3114  transcriptional regulator, LysR family  25.42 
 
 		 304 aa  85.9  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2868  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 303 aa  85.5  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000208433  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2950  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 303 aa  85.5  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.296544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3046  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 303 aa  85.5  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000304897  normal  0.295225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04591  oxidative stress transcriptional regulator  37.5 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0687  transcriptional regulator, LysR family  28.68 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3378  transcriptional regulator, LysR family  30.4 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587515  normal  0.118229 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  24.91 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2805  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>