More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5919 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5919  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  618  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68420  LysR family transcriptional regulator  92.81 
 
 		 306 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.244196  normal  0.506187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03700  Transcriptional regulator, LysR-family  70.21 
 
 		 296 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.207536  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0281  LysR family transcriptional regulator  68.77 
 
 		 295 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4944  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  69.47 
 
 		 293 aa  377  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4601  LysR family transcriptional regulator  63.45 
 
 		 295 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180418  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5405  transcriptional regulator, LysR family  69.47 
 
 		 293 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4130  LysR family transcriptional regulator  63.1 
 
 		 295 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1288  LysR family transcriptional regulator  63.79 
 
 		 295 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.442115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3909  LysR family transcriptional regulator  61.43 
 
 		 295 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2149  LysR family transcriptional regulator  63.67 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000094  Transcriptional regulator, LysR family  56.21 
 
 		 294 aa  329  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2629  transcriptional regulator, LysR family  40.74 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2635  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.136197 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1712  transcriptional regulator, LysR family  41.45 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00729088  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2355  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0259  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4101  transcriptional regulator LysR family  34.03 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0491587  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2350  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 302 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2729  LysR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 297 aa  155  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3197  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4916  transcriptional regulator, LysR family  34.29 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2900  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10118  oxidative stress response regulatory protein oxyS  32.8 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2753  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 320 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.097787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3482  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.532099 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2856  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.73032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8356  transcriptional regulator, LysR family  35.39 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0404  transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4871  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 		 311 aa  149  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0284682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1077  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.337774  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2738  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.154223  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4408  LysR substrate-binding  33.55 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0802  transcriptional regulator, LysR family  32.97 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3928  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3639  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.958787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0749  transcriptional regulator, LysR family protein  35.32 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0987  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1650  transcriptional regulator, LysR family  36.2 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.47658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4031  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  0.632902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3577  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.995392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0842  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  142  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.875433  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4918  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3092  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1874  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.780478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0727  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2595  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4560  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 299 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7619  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0262862  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4648  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2713  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0626  LysR, substrate-binding  31.9 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1847  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2387  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2859  LysR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0203947  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4074  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0823  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2561  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0506375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2452  transcriptional regulator, LysR family  29.72 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1476  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3778  transcriptional regulator, LysR family  28.44 
 
 		 336 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0954002 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3192  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3737  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.440992 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0107  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.73 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3700  transcriptional regulator, LysR family  36.1 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3368  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.92 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.578087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2780  transcriptional regulator, LysR family  44.14 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967057  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1585  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0115  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  27.97 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  27.97 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0198  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0650  transcriptional regulator, LysR family  28.06 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.344002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4861  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.91 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0956909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1896  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5919  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0217311  normal  0.163471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3234  DNA-binding transcriptional regulator CynR  32.11 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.842433  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3761  redox-sensitive transcriptional activator OxyR  27.8 
 
 		 314 aa  95.9  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3833  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 312 aa  95.5  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2817  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.33 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3094  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.57 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.899085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0276  transcriptional regulator, LysR family  31.35 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265614 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2954  transcriptional regulator, LysR family  32.03 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000398128  unclonable  0.0000000375451 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 303 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0727  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.849989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5655  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4781  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.09 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.749024  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4130  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.09 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.717557 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3386  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.09 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4718  hydrogen peroxide-inducible genes activator  30.08 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3755  LysR substrate-binding  27.27 
 
 		 294 aa  92.8  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3425  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.63 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7124  transcriptional regulator, LysR family  31.3 
 
 		 288 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281926  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>