More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2729 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2729  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  578  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2856  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 294 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.73032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2738  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.154223  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0823  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1077  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.337774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0281  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329509 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0842  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.875433  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2753  LysR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.097787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3482  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.532099 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0404  transcriptional regulator, LysR family  35.87 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2387  LysR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4944  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.83 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4130  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493981  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4601  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180418  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1288  LysR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.442115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5405  transcriptional regulator, LysR family  39.42 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3092  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3909  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1847  LysR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3778  transcriptional regulator, LysR family  39.09 
 
 		 336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0954002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7619  transcriptional regulator, LysR family  34.66 
 
 		 340 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0262862  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2713  transcriptional regulator, LysR family  34.66 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2350  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03700  Transcriptional regulator, LysR-family  42.98 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.207536  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4074  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2635  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.136197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0259  transcriptional regulator, LysR family  37.55 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4101  transcriptional regulator LysR family  36.82 
 
 		 311 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0491587  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2859  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 290 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0203947  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3639  transcriptional regulator, LysR family  35.54 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.958787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3197  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 302 aa  148  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3928  transcriptional regulator, LysR family  35.54 
 
 		 297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2149  LysR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3700  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0727  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2900  LysR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4648  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1712  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00729088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5919  LysR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4916  transcriptional regulator, LysR family  37.67 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4560  LysR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4871  transcriptional regulator, LysR family  37.22 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0284682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4031  LysR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  0.632902 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10118  oxidative stress response regulatory protein oxyS  38.27 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2595  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0802  transcriptional regulator, LysR family  36.68 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2452  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4408  LysR substrate-binding  37.22 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0987  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2629  transcriptional regulator, LysR family  35.92 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2355  transcriptional regulator, LysR family  35.51 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000094  Transcriptional regulator, LysR family  36.51 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4918  LysR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2561  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0506375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8356  transcriptional regulator, LysR family  33.81 
 
 		 351 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0626  LysR, substrate-binding  30.39 
 
 		 318 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68420  LysR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.244196  normal  0.506187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3577  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.995392 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1650  transcriptional regulator, LysR family  39.17 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.47658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1476  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3234  DNA-binding transcriptional regulator CynR  37.28 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.842433  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3192  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0115  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 313 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0711  transcriptional regulator, LysR family  32.46 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0749  transcriptional regulator, LysR family protein  28.4 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1896  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2792  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  31.99 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3987  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4718  hydrogen peroxide-inducible genes activator  32.02 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  32.55 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2714  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  36.56 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3588  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3562  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2322  LysR family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2522  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0196222  normal  0.718346 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1874  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.780478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3681  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2340  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37940  DNA-binding transcriptional regulator CynR  36.23 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000278966  normal  0.0117616 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002320  Transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.726256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0896  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948666 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3788  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.9 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0036  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.13 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4775  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  32.11 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760624  hitchhiker  0.00336049 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2780  LysR family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.763495  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2864  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0594  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0821  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0342019  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1422  LysR family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.628384  normal  0.116647 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0103  transcriptional regulator, LysR family  31.86 
 
 		 318 aa  99.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00035  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.46 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4025  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  32 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2941  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 318 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03200  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 300 aa  99.8  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1585  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  99.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0699  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 295 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0856  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 295 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.252777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0844  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 295 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 295 aa  99  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>