More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1384 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1384  ABC transporter related protein  100 
 
 		 294 aa  570  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.514642 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2866  ABC transporter related  48.68 
 
 		 283 aa  211  9e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00634084  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1059  ABC transporter related  45.19 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4355  AbrB family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 329 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0179  AbrB family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1768  ABC transporter related  39.56 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0277  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0956  ABC transporter related protein  41.38 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121187  hitchhiker  0.00122332 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2804  ABC transporter related protein  39.22 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  44.3 
 
 		 563 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  43.66 
 
 		 223 aa  163  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  45.26 
 
 		 565 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26110  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.44 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.157431  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4171  ABC transporter related  38.19 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  39.45 
 
 		 227 aa  149  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  38.74 
 
 		 238 aa  148  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1556  ABC transporter related  37.63 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.798364  normal  0.757355 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  35.48 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  36.28 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  38.99 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  37.28 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  41.41 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  36.17 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  36.96 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  35.4 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  36.65 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  37.33 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  36.73 
 
 		 298 aa  139  7e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  36.32 
 
 		 225 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 234 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  36.54 
 
 		 224 aa  138  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  37.78 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  35.27 
 
 		 240 aa  138  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  37.85 
 
 		 230 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  39.81 
 
 		 224 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  39.53 
 
 		 651 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  36.87 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  33.91 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  34.98 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  36.45 
 
 		 226 aa  136  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 227 aa  136  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60790  ABC transporter ATP-binding protein  41.07 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 		 233 aa  135  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  40.1 
 
 		 224 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1647  ABC transporter related  38.79 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.204823  hitchhiker  0.000330012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  38.84 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  34.53 
 
 		 223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  37.09 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  37.74 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  37.91 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  33.47 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3414  ABC transporter related  41.35 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  30.77 
 
 		 642 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  37.09 
 
 		 234 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  41.35 
 
 		 681 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  38.12 
 
 		 226 aa  133  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  41.35 
 
 		 681 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  38.3 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  36.11 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  32.13 
 
 		 235 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  40.87 
 
 		 687 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  36.28 
 
 		 222 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  33.63 
 
 		 227 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  34.96 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  40.71 
 
 		 655 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  36.94 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  36.28 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  38.14 
 
 		 238 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  35.85 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  31.62 
 
 		 642 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  35.65 
 
 		 226 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0791  ABC transporter related  35.58 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  33.48 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  36.24 
 
 		 652 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  33.48 
 
 		 234 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  35.71 
 
 		 226 aa  130  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  36.94 
 
 		 234 aa  130  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  37.45 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  36.94 
 
 		 234 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  38.12 
 
 		 234 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  38.03 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  38.57 
 
 		 652 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  36.32 
 
 		 242 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  39.82 
 
 		 233 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 		 222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  38.43 
 
 		 663 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  36.44 
 
 		 653 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  34.41 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3482  ABC transporter related protein  37.78 
 
 		 230 aa  129  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  34.62 
 
 		 226 aa  129  8.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 226 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3559  ABC transporter related  41.35 
 
 		 239 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0678  ABC transporter, ATP-binding protein  41.33 
 
 		 225 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.586556  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.65 
 
 		 648 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  36.82 
 
 		 258 aa  129  9.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  36.02 
 
 		 239 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 		 220 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>