More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1556 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1556  ABC transporter related  100 
 
 		 317 aa  625  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.798364  normal  0.757355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26110  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  73.85 
 
 		 340 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.157431  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0956  ABC transporter related protein  67.35 
 
 		 346 aa  381  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121187  hitchhiker  0.00122332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4171  ABC transporter related  62.54 
 
 		 339 aa  358  5e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1768  ABC transporter related  60.82 
 
 		 315 aa  347  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2804  ABC transporter related protein  60.79 
 
 		 366 aa  296  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0791  ABC transporter related  52.45 
 
 		 311 aa  287  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0277  ABC transporter related protein  49.64 
 
 		 334 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4355  AbrB family transcriptional regulator  48.38 
 
 		 329 aa  252  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0179  AbrB family transcriptional regulator  48.01 
 
 		 328 aa  250  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  45.57 
 
 		 565 aa  232  8.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  45.51 
 
 		 563 aa  229  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  43.24 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  40.28 
 
 		 223 aa  185  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  44.04 
 
 		 234 aa  185  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  41.89 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  41.07 
 
 		 225 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  42.99 
 
 		 220 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  42.92 
 
 		 230 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  38.86 
 
 		 242 aa  182  6e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  46.35 
 
 		 236 aa  182  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.73 
 
 		 233 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  42.27 
 
 		 237 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  41.83 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  42.53 
 
 		 236 aa  180  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  40.45 
 
 		 234 aa  179  5.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 225 aa  179  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  44.98 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  38.84 
 
 		 238 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  40.27 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  42.47 
 
 		 221 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  41.3 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  43.18 
 
 		 715 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  41.44 
 
 		 248 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  41.26 
 
 		 225 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  41.44 
 
 		 248 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  44.61 
 
 		 233 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  41.63 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  44.61 
 
 		 241 aa  176  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  42.01 
 
 		 224 aa  175  7e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  37.61 
 
 		 231 aa  176  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  43.98 
 
 		 240 aa  175  9e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  41.55 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  44.65 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  38.5 
 
 		 227 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  41.85 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  41.1 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  40.27 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  40.18 
 
 		 230 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  39.01 
 
 		 225 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 239 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  45.41 
 
 		 653 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  37.34 
 
 		 642 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  38.96 
 
 		 246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  43.38 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 225 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  43.38 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  39.48 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  45.83 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  43.89 
 
 		 245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  43.53 
 
 		 240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  42.41 
 
 		 253 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1694  peptide ABC transporter ATPase  36.36 
 
 		 248 aa  173  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000011753  unclonable  4.03836e-28 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  40.64 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  40.71 
 
 		 277 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  41.1 
 
 		 247 aa  172  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  37.89 
 
 		 225 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  37.89 
 
 		 225 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  36.13 
 
 		 642 aa  171  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  44.19 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  40 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  44.19 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1744  ABC transporter related protein  40.53 
 
 		 246 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  39.65 
 
 		 228 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  47.2 
 
 		 244 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  38.64 
 
 		 248 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  43.1 
 
 		 240 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  38.86 
 
 		 256 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1404  ABC transporter related  45.5 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  43.1 
 
 		 240 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  41.85 
 
 		 652 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  38.53 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  38.81 
 
 		 234 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  40.83 
 
 		 232 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  41.07 
 
 		 235 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  37.44 
 
 		 240 aa  170  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  43.75 
 
 		 238 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  41.31 
 
 		 238 aa  170  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.05 
 
 		 233 aa  170  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  37.05 
 
 		 233 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.05 
 
 		 233 aa  170  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  37.05 
 
 		 233 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  38.99 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  41.79 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 		 219 aa  169  5e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.05 
 
 		 233 aa  169  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  43.78 
 
 		 217 aa  169  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 		 230 aa  169  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>