More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1059 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1059  ABC transporter related  100 
 
 		 283 aa  544  1e-154  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2866  ABC transporter related  47.7 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00634084  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1384  ABC transporter related protein  46.1 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.514642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0956  ABC transporter related protein  41.54 
 
 		 346 aa  178  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121187  hitchhiker  0.00122332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1768  ABC transporter related  41.37 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0179  AbrB family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4355  AbrB family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 329 aa  168  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  38.06 
 
 		 565 aa  168  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26110  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.4 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.157431  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  37.76 
 
 		 563 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2804  ABC transporter related protein  39.57 
 
 		 366 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  40.62 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1556  ABC transporter related  39.53 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.798364  normal  0.757355 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  37.33 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4171  ABC transporter related  35.99 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0277  ABC transporter related protein  35.36 
 
 		 334 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03410  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  44.05 
 
 		 354 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  39.47 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 		 319 aa  149  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  40 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  41.47 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  39.91 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  43.81 
 
 		 230 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  40 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  40 
 
 		 242 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  43.81 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  40.45 
 
 		 241 aa  145  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0791  ABC transporter related  36.29 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  40.28 
 
 		 252 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  44.12 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  39.09 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  39.37 
 
 		 223 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  42.53 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3559  ABC transporter related  42.56 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  34.4 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  35.29 
 
 		 230 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  34.06 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 223 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  38.16 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  40.17 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  38.77 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  37.39 
 
 		 228 aa  142  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 		 248 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3410  ABC transporter, ATPase subunit  44.81 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.072759  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  40.45 
 
 		 252 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  42.79 
 
 		 240 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  42.79 
 
 		 240 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0890  ABC transporter related  43.11 
 
 		 233 aa  142  9e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999916  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  35.91 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3788  ABC transporter related  41.28 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  40.42 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  35.91 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  41.2 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  36.36 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  37.17 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  38.05 
 
 		 715 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  40.42 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  40.42 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  40.42 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2536  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.6 
 
 		 352 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0300192  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  35.81 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  38.74 
 
 		 222 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  44.06 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  41.78 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.15 
 
 		 378 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3160  ABC transporter related protein  41.43 
 
 		 332 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0152583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  42.2 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 408 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  35.9 
 
 		 347 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  41.23 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 		 223 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  34.67 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0285  ABC transporter related  42.8 
 
 		 334 aa  139  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0897858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  40.83 
 
 		 256 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  35.45 
 
 		 221 aa  139  6e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  35.57 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  35.57 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 		 233 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 		 233 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  35.57 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  35.75 
 
 		 225 aa  139  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  42.65 
 
 		 240 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  35.57 
 
 		 339 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2912  ABC transporter ATP-binding protein  41 
 
 		 366 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 342 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  33.93 
 
 		 237 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  42.15 
 
 		 687 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  40.91 
 
 		 233 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  35.57 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  35.57 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  38.43 
 
 		 235 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  33.49 
 
 		 223 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  40.27 
 
 		 228 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3414  ABC transporter related  41.35 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  34.4 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>