More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26110 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26110  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 		 340 aa  665    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.157431  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1556  ABC transporter related  73.85 
 
 		 317 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.798364  normal  0.757355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0956  ABC transporter related protein  66.9 
 
 		 346 aa  359  4e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121187  hitchhiker  0.00122332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1768  ABC transporter related  59.42 
 
 		 315 aa  338  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4171  ABC transporter related  60.85 
 
 		 339 aa  332  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2804  ABC transporter related protein  60.14 
 
 		 366 aa  295  6e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0791  ABC transporter related  50.16 
 
 		 311 aa  282  5.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0277  ABC transporter related protein  49.13 
 
 		 334 aa  269  5e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4355  AbrB family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 329 aa  260  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0179  AbrB family transcriptional regulator  49.82 
 
 		 328 aa  256  6e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  47.55 
 
 		 565 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  47.54 
 
 		 563 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  43.64 
 
 		 234 aa  188  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  47.29 
 
 		 221 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  46.33 
 
 		 234 aa  186  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  43.44 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  44.95 
 
 		 226 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  44.23 
 
 		 225 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  43.4 
 
 		 225 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  43.4 
 
 		 225 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  46.22 
 
 		 252 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  43.54 
 
 		 228 aa  182  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  42.99 
 
 		 222 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  45.37 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  47.26 
 
 		 217 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  48.02 
 
 		 240 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  44.34 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.58 
 
 		 225 aa  179  7e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 238 aa  179  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  47.96 
 
 		 239 aa  179  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  40.18 
 
 		 240 aa  178  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  41.44 
 
 		 229 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  45.7 
 
 		 715 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  43.84 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 220 aa  177  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  44.44 
 
 		 240 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  39.11 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  43.69 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  39.04 
 
 		 238 aa  176  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  40.82 
 
 		 277 aa  176  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  38.6 
 
 		 242 aa  176  7e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  40.89 
 
 		 253 aa  175  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  43.29 
 
 		 241 aa  175  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  42.79 
 
 		 228 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  44.49 
 
 		 253 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.36 
 
 		 225 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  44.4 
 
 		 245 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  43.05 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  46.51 
 
 		 225 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  40.74 
 
 		 235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  44 
 
 		 240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  44.49 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  44 
 
 		 240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  45.65 
 
 		 653 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  44.06 
 
 		 221 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  46.53 
 
 		 232 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  41.7 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  40.74 
 
 		 235 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  46.38 
 
 		 228 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  40.62 
 
 		 246 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  42.34 
 
 		 230 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  45.05 
 
 		 707 aa  172  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  37.72 
 
 		 223 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  42.86 
 
 		 237 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  41.26 
 
 		 225 aa  172  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  40.47 
 
 		 221 aa  172  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  43.75 
 
 		 225 aa  172  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  38.82 
 
 		 248 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  41.13 
 
 		 252 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  40.55 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  43.81 
 
 		 240 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 224 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  47.8 
 
 		 236 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  40.74 
 
 		 230 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  42.48 
 
 		 240 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  40.78 
 
 		 230 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  37.45 
 
 		 237 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  41.78 
 
 		 251 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  40.09 
 
 		 233 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  41.79 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  40.09 
 
 		 233 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  40.36 
 
 		 245 aa  170  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.09 
 
 		 233 aa  170  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.84 
 
 		 232 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  41.55 
 
 		 225 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1694  peptide ABC transporter ATPase  35.12 
 
 		 248 aa  170  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000011753  unclonable  4.03836e-28 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.09 
 
 		 233 aa  170  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  41.15 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.09 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.09 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.61 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  41.4 
 
 		 230 aa  169  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.09 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 232 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  42.18 
 
 		 228 aa  169  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  41.5 
 
 		 238 aa  169  7e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.95 
 
 		 232 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.18 
 
 		 259 aa  169  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>