More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0791 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0791  ABC transporter related  100 
 
 
311 aa  621  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0956  ABC transporter related protein  54.48 
 
 
346 aa  295  5e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121187  hitchhiker  0.00122332 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26110  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.97 
 
 
340 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.157431  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1556  ABC transporter related  52.8 
 
 
317 aa  281  7.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.798364  normal  0.757355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1768  ABC transporter related  49.14 
 
 
315 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4171  ABC transporter related  50.68 
 
 
339 aa  268  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2804  ABC transporter related protein  50.51 
 
 
366 aa  255  8e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0277  ABC transporter related protein  42.09 
 
 
334 aa  223  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  43.34 
 
 
565 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4355  AbrB family transcriptional regulator  42.19 
 
 
329 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0179  AbrB family transcriptional regulator  42.19 
 
 
328 aa  219  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  42.56 
 
 
563 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  40.62 
 
 
234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  41.82 
 
 
231 aa  172  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  44.8 
 
 
248 aa  170  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  42.4 
 
 
238 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.94 
 
 
234 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  40.83 
 
 
237 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  42.41 
 
 
226 aa  166  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  38.66 
 
 
230 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  40.62 
 
 
715 aa  165  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  40.18 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  39.56 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 
234 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  41.92 
 
 
228 aa  162  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  38.22 
 
 
229 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  40.61 
 
 
222 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  40.89 
 
 
225 aa  161  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  37.05 
 
 
277 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  39.56 
 
 
224 aa  160  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  41.3 
 
 
298 aa  160  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  41.78 
 
 
237 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  37.44 
 
 
242 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  43.75 
 
 
650 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  38.79 
 
 
227 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  40.83 
 
 
239 aa  160  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  40.61 
 
 
222 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  43.11 
 
 
253 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  43.11 
 
 
253 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  42.2 
 
 
233 aa  159  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  40.26 
 
 
233 aa  159  8e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0986  ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
232 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  37.67 
 
 
227 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  37.23 
 
 
236 aa  158  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  38.39 
 
 
223 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  36.4 
 
 
259 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  36.32 
 
 
226 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  41.07 
 
 
224 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
649 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.89 
 
 
249 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  36 
 
 
234 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  33.85 
 
 
242 aa  157  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  40.53 
 
 
221 aa  156  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
220 aa  156  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  39.04 
 
 
225 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  34.38 
 
 
224 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  39.91 
 
 
228 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  37.05 
 
 
238 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  41.82 
 
 
250 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  35.96 
 
 
230 aa  155  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  40.45 
 
 
244 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  37.5 
 
 
241 aa  155  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  41.52 
 
 
653 aa  155  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
248 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  36.44 
 
 
234 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  39.22 
 
 
252 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  37.34 
 
 
256 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  37.71 
 
 
266 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  43.33 
 
 
219 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  37.67 
 
 
225 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  41.28 
 
 
235 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  38.86 
 
 
388 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1601  ABC transporter, ATP-binding protein  36.89 
 
 
224 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  37.5 
 
 
228 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  35.56 
 
 
234 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  40.19 
 
 
220 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  40.44 
 
 
225 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  38.79 
 
 
293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  37.95 
 
 
239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  39.38 
 
 
237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  37.08 
 
 
240 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  38.05 
 
 
233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  39.74 
 
 
225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  39.74 
 
 
225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  38.4 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  34.52 
 
 
241 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  31.97 
 
 
235 aa  153  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  36 
 
 
240 aa  153  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  36.89 
 
 
252 aa  153  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  40.09 
 
 
236 aa  153  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  37.78 
 
 
230 aa  153  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  38.22 
 
 
253 aa  152  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  38.4 
 
 
277 aa  152  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  40.18 
 
 
244 aa  153  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  38.46 
 
 
251 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.27 
 
 
249 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 
249 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  38.84 
 
 
230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  42.01 
 
 
238 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 
240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>