More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6650 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5697  ABC transporter related  93.85 
 
 		 585 aa  1028    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.435877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6650  ABC transporter related  100 
 
 		 585 aa  1147    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154818  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4424  ABC transporter related  66.07 
 
 		 601 aa  689    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.612186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1308  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  53.13 
 
 		 620 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.832531  normal  0.97267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0054  ABC transporter related  51.37 
 
 		 604 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5902  ABC transporter related  54.96 
 
 		 616 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656172  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  50.45 
 
 		 583 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  29.93 
 
 		 621 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  32.01 
 
 		 842 aa  233  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  29.92 
 
 		 852 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  30.16 
 
 		 838 aa  223  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  31.87 
 
 		 859 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  29.03 
 
 		 632 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  31.4 
 
 		 840 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  30.24 
 
 		 598 aa  209  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  28.8 
 
 		 625 aa  209  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  30.22 
 
 		 840 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  30.97 
 
 		 594 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  29.77 
 
 		 840 aa  206  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.81 
 
 		 594 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29 
 
 		 594 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  30.81 
 
 		 594 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  30.64 
 
 		 594 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  30.97 
 
 		 594 aa  203  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  29.82 
 
 		 589 aa  203  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  28.83 
 
 		 594 aa  203  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  30.87 
 
 		 590 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  30.64 
 
 		 594 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  28.17 
 
 		 589 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  29.86 
 
 		 589 aa  202  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  30.64 
 
 		 594 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  30.62 
 
 		 616 aa  200  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.55 
 
 		 594 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  29.67 
 
 		 950 aa  200  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  30.55 
 
 		 594 aa  200  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.55 
 
 		 594 aa  200  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  27.44 
 
 		 582 aa  199  9e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  30.55 
 
 		 594 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.55 
 
 		 594 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.55 
 
 		 594 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.55 
 
 		 594 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  29.22 
 
 		 594 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  30.2 
 
 		 590 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  29.89 
 
 		 594 aa  197  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  29.98 
 
 		 593 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  29.32 
 
 		 599 aa  195  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.03 
 
 		 609 aa  195  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  30.02 
 
 		 590 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  29.89 
 
 		 608 aa  192  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  29.89 
 
 		 608 aa  192  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  29.19 
 
 		 594 aa  192  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  30.76 
 
 		 617 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  27.63 
 
 		 603 aa  191  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  30.22 
 
 		 823 aa  189  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  28.01 
 
 		 597 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  30.32 
 
 		 823 aa  188  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  31.06 
 
 		 588 aa  187  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  30.71 
 
 		 827 aa  187  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  30.05 
 
 		 613 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  30.37 
 
 		 589 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  28.77 
 
 		 863 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  30.34 
 
 		 610 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  31.48 
 
 		 586 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  29.56 
 
 		 590 aa  184  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  29.81 
 
 		 599 aa  183  9.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  29.35 
 
 		 595 aa  183  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  29.19 
 
 		 604 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  29.86 
 
 		 589 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  28.69 
 
 		 631 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  28.07 
 
 		 593 aa  179  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  30.99 
 
 		 954 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  30.28 
 
 		 822 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  29.28 
 
 		 608 aa  178  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3237  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.11 
 
 		 259 aa  177  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314824  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  27.52 
 
 		 616 aa  177  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  28.38 
 
 		 630 aa  177  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  27.94 
 
 		 951 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  29.09 
 
 		 597 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  26.39 
 
 		 593 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  29.48 
 
 		 583 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  28.77 
 
 		 565 aa  171  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  29.42 
 
 		 830 aa  170  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  29.29 
 
 		 604 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1253  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  36.14 
 
 		 244 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  27.59 
 
 		 606 aa  167  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  36.29 
 
 		 271 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  27.68 
 
 		 593 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  29.42 
 
 		 597 aa  166  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  29.46 
 
 		 608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  26.33 
 
 		 611 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1821  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 382 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  26.97 
 
 		 603 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2146  ABC transporter related  28.34 
 
 		 606 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0703  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  36.58 
 
 		 302 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  28.35 
 
 		 608 aa  164  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3501  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  36.93 
 
 		 257 aa  163  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.638418  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  26.18 
 
 		 663 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  28.12 
 
 		 832 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 271 aa  161  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  25.31 
 
 		 660 aa  161  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>