More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1253 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1253  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 		 244 aa  494  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1047  ABC transporter related  61.25 
 
 		 244 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0944  ABC transporter related  59.58 
 
 		 244 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5756  ABC transporter related  45.08 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.638783  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0806  ABC transporter related  43.5 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3319  ABC transporter related  41.39 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  42.28 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  42.28 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3237  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  43.21 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314824  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3017  ABC transporter related  40.5 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.207365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  44.26 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  45.45 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  43.09 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  43.09 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3205  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.8 
 
 		 238 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  43.09 
 
 		 255 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2666  ABC transporter related  41.15 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297517  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  41.22 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6327  ABC transporter related  45.49 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  44.67 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513247  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  44.03 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3501  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.83 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.638418  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  42.21 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 		 250 aa  188  9e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1288  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.63 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  44.63 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  45.12 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4289  ABC transporter related  44.63 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00311988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  42.62 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  41.46 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2989  ABC transporter ATP-binding protein  40.91 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  41.3 
 
 		 263 aa  184  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  41.7 
 
 		 252 aa  184  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2593  ABC transporter-related protein  42.15 
 
 		 277 aa  184  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.479665  normal  0.611604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.93 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  38.93 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6115  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.65 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  42.11 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  40.65 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.06 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0229  histidine kinase  37.45 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1563  ABC transporter related protein  38.93 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  42.11 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  38.93 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  39.76 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  41.46 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  41.46 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0703  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.08 
 
 		 302 aa  182  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  41.06 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2972  ABC transporter related  41.06 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0083  ABC transporter related  41.06 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  39.92 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2327  ABC transporter related  41.08 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.47517  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2335  ABC transporter related  41.08 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448695  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1851  ABC transporter related  36.4 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28249  normal  0.201191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2288  ABC transporter related  41.08 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  40.57 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1653  ABC transporter related  37.55 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  41.46 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  45.08 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.89 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1820  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 252 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.257202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0083  ABC transporter related  40.65 
 
 		 259 aa  178  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4753  ABC transporter-related protein  40.49 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  39.34 
 
 		 255 aa  178  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1584  ABC transporter related  40.16 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3699  ABC transporter related  38.27 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.34 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3689  ABC transporter-related protein  37.04 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  40.89 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3801  ABC transporter related  41.32 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  41.06 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  40.41 
 
 		 263 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2247  ATPase  41.08 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2792  ABC transporter related protein  41.94 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  41.7 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1594  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  34.85 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3864  ABC transporter related  37.6 
 
 		 252 aa  175  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2775  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  38.52 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  41.06 
 
 		 250 aa  175  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  40 
 
 		 859 aa  175  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4075  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3208  ABC transporter related  42.24 
 
 		 291 aa  175  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  42.68 
 
 		 251 aa  174  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  38.87 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4188  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  36.48 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  38.37 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0657  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.17 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.357814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>