More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1821 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1821  inner-membrane translocator  100 
 
 		 382 aa  756    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2776  urea ABC transporter, permease protein UrtC  58.41 
 
 		 352 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4363  inner-membrane translocator  51 
 
 		 372 aa  335  5.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5670  urea ABC transporter, permease protein UrtC  51.55 
 
 		 389 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3734  inner-membrane translocator  50.3 
 
 		 389 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4634  inner-membrane translocator  50 
 
 		 389 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1709  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  49.25 
 
 		 387 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0393894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2258  urea ABC transporter, permease protein UrtC  49.09 
 
 		 398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0566  inner-membrane translocator  48.53 
 
 		 411 aa  324  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3589  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.05 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3143  urea ABC transporter, permease protein UrtC  47.29 
 
 		 401 aa  323  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0128  inner-membrane translocator  47.9 
 
 		 393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3238  urea ABC transporter, permease protein UrtC  48.8 
 
 		 368 aa  319  5e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689363  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0978  urea ABC transporter, permease protein UrtC  47.38 
 
 		 376 aa  318  7.999999999999999e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903791  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4076  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.25 
 
 		 391 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1773  inner-membrane translocator  46.29 
 
 		 389 aa  316  4e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.874447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0222  urea ABC transporter, permease protein UrtC  49.84 
 
 		 396 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1672  urea ABC transporter, permease protein UrtC  48.06 
 
 		 392 aa  312  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19171  putative membrane protein of urea ABC transport system  45.65 
 
 		 375 aa  309  5.9999999999999995e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.514587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2864  urea ABC transporter, permease protein UrtC  47.58 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2973  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.48 
 
 		 383 aa  306  5.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.604364  normal  0.198493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2416  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.69 
 
 		 380 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2744  urea ABC transporter, permease protein UrtC  45.56 
 
 		 358 aa  305  7e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4908  inner-membrane translocator  49.23 
 
 		 351 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4151  inner-membrane translocator  45.48 
 
 		 375 aa  302  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0190  inner-membrane translocator  48.1 
 
 		 364 aa  302  6.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4010  urea ABC transporter, permease protein UrtC  44.79 
 
 		 405 aa  302  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2005  urea ABC transporter, permease protein UrtC  49.52 
 
 		 361 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1046  putative membrane protein of urea ABC transport system  46.59 
 
 		 371 aa  301  9e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.812032  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08861  putative membrane protein of urea ABC transport system  44.89 
 
 		 376 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2203  inner-membrane translocator  47.69 
 
 		 380 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1595  urea ABC transporter, permease protein UrtC  48.51 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08841  putative membrane protein of urea ABC transport system  44.57 
 
 		 376 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0827  putative membrane protein of urea ABC transport system  44.32 
 
 		 376 aa  299  7e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2191  urea ABC transporter, permease protein UrtC  46.2 
 
 		 388 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5510  urea ABC transporter, permease protein UrtC  51.58 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.762054 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1200  inner-membrane translocator  46.3 
 
 		 380 aa  296  5e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.729253  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1868  urea ABC transporter, permease protein UrtC  45.91 
 
 		 389 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514988  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1445  urea ABC transporter, permease protein UrtC  49.2 
 
 		 383 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2618  putative membrane protein of urea ABC transport system  45.85 
 
 		 382 aa  295  1e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0303421  normal  0.395432 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0950  inner-membrane translocator  45.76 
 
 		 377 aa  294  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4428  inner-membrane translocator  47.91 
 
 		 359 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1257  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  45.3 
 
 		 363 aa  294  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.606412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4887  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.55 
 
 		 359 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599919  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3570  urea ABC transporter, permease protein UrtC  50.61 
 
 		 393 aa  293  5e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.107827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3688  urea ABC transporter, permease protein UrtC  50.95 
 
 		 393 aa  293  5e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3379  urea ABC transporter, permease protein UrtC  50.95 
 
 		 393 aa  293  5e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3379  inner-membrane translocator  45.8 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0588  inner-membrane translocator  47.62 
 
 		 359 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.98768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4012  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  47.98 
 
 		 395 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0110439  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0595  urea ABC transporter, permease protein UrtC  50 
 
 		 384 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0699  putative permease transporter transmembrane protein  47.08 
 
 		 378 aa  290  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0568286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0999  inner-membrane translocator  47.51 
 
 		 403 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0908  inner-membrane translocator  47.98 
 
 		 395 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0429  inner-membrane translocator  47.98 
 
 		 395 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2484  urea ABC transporter, permease protein UrtC  46.71 
 
 		 406 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0878  urea ABC transporter, permease protein UrtC  47.98 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1395  inner-membrane translocator  48.11 
 
 		 377 aa  290  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal  0.615591 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0796  urea ABC transporter, permease protein UrtC  48.29 
 
 		 394 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0785  inner-membrane translocator  48.29 
 
 		 394 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4635  urea ABC transporter, permease protein UrtC  46.79 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4900  urea ABC transporter, permease protein UrtC  46.79 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153709 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2999  inner-membrane translocator  42.19 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1502  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.39 
 
 		 401 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4227  urea ABC transporter, permease protein UrtC  43.63 
 
 		 418 aa  286  5e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.338662  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4843  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  46.15 
 
 		 359 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.227032 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3114  urea ABC transporter, permease protein UrtC  44.44 
 
 		 382 aa  285  8e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1436  inner-membrane translocator  45.82 
 
 		 371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4721  inner-membrane translocator  46.15 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131365  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1990  inner-membrane translocator  47.92 
 
 		 357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2253  urea ABC transporter, permease protein UrtC  48.59 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.731994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3498  inner-membrane translocator  44.66 
 
 		 385 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3209  inner-membrane translocator  45.69 
 
 		 372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0890625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2697  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system  44.79 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.611923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00883  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  45.23 
 
 		 392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3129  putative branched-chain amino acid transport system, permease component  46.39 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1101  urea ABC transporter, permease protein UrtC  45.43 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1423  inner-membrane translocator  47.26 
 
 		 358 aa  282  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2178  branched-chain ABC transporter, permease protein, putative  46.39 
 
 		 340 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0730  putative amino acid ABC transporter, permease protein  46.39 
 
 		 340 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2050  putative amino acid ABC transporter, permease protein  46.39 
 
 		 340 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.525267  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2563  putative amino acid ABC transporter, permease protein  46.39 
 
 		 340 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.589249  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3069  putative amino acid ABC transporter, permease protein  46.39 
 
 		 400 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3105  putative amino acid ABC transporter, permease protein  46.39 
 
 		 400 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2248  putative membrane protein of ABC transport system  46.01 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2159  urea ABC transporter, permease protein UrtC  47.94 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.708792  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0954  inner-membrane translocator  46.42 
 
 		 400 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449226  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2988  ABC transporter inner-membrane translocator  40.51 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.641521 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0952  urea ABC transporter, permease protein UrtC  48.17 
 
 		 394 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3933  urea ABC transporter, permease protein UrtC  45.45 
 
 		 414 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3685  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  48.17 
 
 		 393 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3508  inner-membrane translocator  45.05 
 
 		 397 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3862  inner-membrane translocator  45.01 
 
 		 383 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.938574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4189  urea ABC transporter, permease protein UrtC  45.1 
 
 		 391 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7016  branched chain amino acid ABC transporter permease  43.16 
 
 		 387 aa  279  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.770663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1445  urea ABC transporter, permease protein UrtC  45.71 
 
 		 384 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808643 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1254  inner-membrane translocator  48.24 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0656  branched chain amino acid ABC transporter permease  48.49 
 
 		 379 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.370011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64290  putative permease of ABC transporter  48.18 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1796  inner-membrane translocator  44.08 
 
 		 401 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0666603  normal  0.204182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>