More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2484 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0878  urea ABC transporter, permease protein UrtC  92.88 
 
 
395 aa  702    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3105  putative amino acid ABC transporter, permease protein  91.03 
 
 
400 aa  675    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3129  putative branched-chain amino acid transport system, permease component  90.76 
 
 
400 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4012  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  92.37 
 
 
395 aa  713    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0110439  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2484  urea ABC transporter, permease protein UrtC  100 
 
 
406 aa  801    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1502  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  90.49 
 
 
401 aa  669    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3069  putative amino acid ABC transporter, permease protein  91.03 
 
 
400 aa  674    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0796  urea ABC transporter, permease protein UrtC  91.6 
 
 
394 aa  712    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0429  inner-membrane translocator  92.62 
 
 
395 aa  700    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2253  urea ABC transporter, permease protein UrtC  83.92 
 
 
398 aa  639    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.731994  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0785  inner-membrane translocator  90.84 
 
 
394 aa  710    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0908  inner-membrane translocator  92.62 
 
 
395 aa  700    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2178  branched-chain ABC transporter, permease protein, putative  90.59 
 
 
340 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2563  putative amino acid ABC transporter, permease protein  90.59 
 
 
340 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.589249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2050  putative amino acid ABC transporter, permease protein  90.59 
 
 
340 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.525267  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3685  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  83.55 
 
 
393 aa  621  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0730  putative amino acid ABC transporter, permease protein  90.59 
 
 
340 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0952  urea ABC transporter, permease protein UrtC  86.61 
 
 
394 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1200  inner-membrane translocator  67.72 
 
 
380 aa  550  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.729253  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2191  urea ABC transporter, permease protein UrtC  74.66 
 
 
388 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1868  urea ABC transporter, permease protein UrtC  74.12 
 
 
389 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514988  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0954  inner-membrane translocator  73.77 
 
 
400 aa  538  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449226  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0988  inner-membrane translocator  73.5 
 
 
404 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2039  ABC transporter permease  75.49 
 
 
396 aa  513  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal  0.266776 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1436  inner-membrane translocator  67.13 
 
 
371 aa  491  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0699  putative permease transporter transmembrane protein  67.22 
 
 
378 aa  481  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0568286  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3933  urea ABC transporter, permease protein UrtC  64.86 
 
 
414 aa  475  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1395  inner-membrane translocator  63.09 
 
 
377 aa  472  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal  0.615591 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0999  inner-membrane translocator  60.1 
 
 
403 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4010  urea ABC transporter, permease protein UrtC  62.53 
 
 
405 aa  468  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3379  inner-membrane translocator  62.88 
 
 
367 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3209  inner-membrane translocator  64.25 
 
 
372 aa  459  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0890625  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3498  inner-membrane translocator  62.54 
 
 
385 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1086  urea ABC transporter, permease protein UrtC  64.33 
 
 
372 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4887  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  65.62 
 
 
359 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599919  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4428  inner-membrane translocator  65.62 
 
 
359 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0588  inner-membrane translocator  66.06 
 
 
359 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.98768  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5581  urea ABC transporter permease UrtC  64.72 
 
 
359 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64290  putative permease of ABC transporter  69.16 
 
 
359 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374453  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4843  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  65.96 
 
 
359 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.227032 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2744  urea ABC transporter, permease protein UrtC  61.99 
 
 
358 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4635  urea ABC transporter, permease protein UrtC  66.15 
 
 
359 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4900  urea ABC transporter, permease protein UrtC  66.25 
 
 
359 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0153709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4721  inner-membrane translocator  66.15 
 
 
359 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131365  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3700  inner-membrane translocator  60.62 
 
 
389 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.845497  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0950  inner-membrane translocator  58.4 
 
 
377 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7016  branched chain amino acid ABC transporter permease  59.21 
 
 
387 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.770663 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2988  ABC transporter inner-membrane translocator  58.96 
 
 
390 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.641521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4189  urea ABC transporter, permease protein UrtC  58.99 
 
 
391 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2159  urea ABC transporter, permease protein UrtC  67.3 
 
 
358 aa  401  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.708792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1423  inner-membrane translocator  62.43 
 
 
358 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4151  inner-membrane translocator  57.64 
 
 
375 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00883  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  57.31 
 
 
392 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3508  inner-membrane translocator  60.81 
 
 
397 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288069  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2498  urea ABC transporter, permease protein UrtC  66.98 
 
 
362 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0421862  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0699  inner-membrane translocator  64.91 
 
 
363 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.813237  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2999  inner-membrane translocator  60.18 
 
 
377 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1445  urea ABC transporter, permease protein UrtC  56.08 
 
 
384 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808643 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1796  inner-membrane translocator  61.44 
 
 
401 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0666603  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3316  urea ABC transporter, permease protein UrtC  60.61 
 
 
387 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.852064 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1990  inner-membrane translocator  63.04 
 
 
357 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1101  urea ABC transporter, permease protein UrtC  57.27 
 
 
383 aa  386  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3491  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  58.68 
 
 
386 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2697  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system  58.26 
 
 
367 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.611923  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2618  urea ABC transporter, permease protein UrtC  57.38 
 
 
382 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2871  urea ABC transporter, permease protein UrtC  62.65 
 
 
358 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00794762  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1338  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  62.65 
 
 
358 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.547268 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2792  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  62.65 
 
 
358 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0228  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like  59.63 
 
 
432 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.836611 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4186  inner-membrane translocator  58.89 
 
 
388 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.35336 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0992  inner-membrane translocator  59.65 
 
 
356 aa  375  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3061  urea ABC transporter, permease protein UrtC  59.16 
 
 
387 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.992528  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1021  inner-membrane translocator  56.98 
 
 
384 aa  364  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.744628  normal  0.313599 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0190  inner-membrane translocator  56.02 
 
 
364 aa  361  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4607  urea ABC transporter, permease protein UrtC  58.41 
 
 
381 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4227  urea ABC transporter, permease protein UrtC  46.46 
 
 
418 aa  328  8e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.338662  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1821  inner-membrane translocator  46.71 
 
 
382 aa  276  5e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2311  inner-membrane translocator  45.15 
 
 
350 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.90856  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1257  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  44.72 
 
 
363 aa  270  4e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.606412 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4363  inner-membrane translocator  43.73 
 
 
372 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283933  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2776  urea ABC transporter, permease protein UrtC  43.44 
 
 
352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1672  urea ABC transporter, permease protein UrtC  44.94 
 
 
392 aa  243  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2258  urea ABC transporter, permease protein UrtC  42.12 
 
 
398 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1943  inner-membrane translocator  43.97 
 
 
410 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0299  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  44.25 
 
 
410 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0128  inner-membrane translocator  40.06 
 
 
393 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4019  inner-membrane translocator  43.62 
 
 
411 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.70134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3238  urea ABC transporter, permease protein UrtC  40.85 
 
 
368 aa  226  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2864  urea ABC transporter, permease protein UrtC  39.69 
 
 
385 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0978  urea ABC transporter, permease protein UrtC  37.19 
 
 
376 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903791  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2618  putative membrane protein of urea ABC transport system  40.13 
 
 
382 aa  224  3e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0303421  normal  0.395432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0995  inner-membrane translocator  42.3 
 
 
410 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178481  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08861  putative membrane protein of urea ABC transport system  37.78 
 
 
376 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0827  putative membrane protein of urea ABC transport system  37.78 
 
 
376 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2973  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 
383 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.604364  normal  0.198493 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19171  putative membrane protein of urea ABC transport system  35.82 
 
 
375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.514587  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08841  putative membrane protein of urea ABC transport system  37.78 
 
 
376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4908  inner-membrane translocator  37.15 
 
 
351 aa  221  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3589  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.57 
 
 
404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1046  putative membrane protein of urea ABC transport system  37.38 
 
 
371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.812032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>