More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2005 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2005  urea ABC transporter, permease protein UrtC  100 
 
 		 361 aa  696    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1821  inner-membrane translocator  48.61 
 
 		 382 aa  309  5.9999999999999995e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2776  urea ABC transporter, permease protein UrtC  49.85 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5670  urea ABC transporter, permease protein UrtC  48.05 
 
 		 389 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1672  urea ABC transporter, permease protein UrtC  47.9 
 
 		 392 aa  295  9e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4634  inner-membrane translocator  47.75 
 
 		 389 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0978  urea ABC transporter, permease protein UrtC  44.24 
 
 		 376 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2973  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.77 
 
 		 383 aa  293  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.604364  normal  0.198493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0566  inner-membrane translocator  45.68 
 
 		 411 aa  292  8e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3734  inner-membrane translocator  47.45 
 
 		 389 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1773  inner-membrane translocator  46.41 
 
 		 389 aa  290  4e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.874447  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4076  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.76 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224441  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1709  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  46.87 
 
 		 387 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0393894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3238  urea ABC transporter, permease protein UrtC  48.14 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689363  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4363  inner-membrane translocator  47.2 
 
 		 372 aa  285  7e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4908  inner-membrane translocator  44 
 
 		 351 aa  284  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0222  urea ABC transporter, permease protein UrtC  49.37 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0128  inner-membrane translocator  45.51 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3589  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.24 
 
 		 404 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3143  urea ABC transporter, permease protein UrtC  47.47 
 
 		 401 aa  278  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1445  urea ABC transporter, permease protein UrtC  45.61 
 
 		 383 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2336  inner-membrane translocator  46.37 
 
 		 367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112184  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2289  inner-membrane translocator  46.37 
 
 		 367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995784  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2328  inner-membrane translocator  46.37 
 
 		 367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228021  normal  0.0755161 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08841  putative membrane protein of urea ABC transport system  45.05 
 
 		 376 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3800  inner-membrane translocator  45.38 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08861  putative membrane protein of urea ABC transport system  44.73 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2416  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.77 
 
 		 380 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1595  urea ABC transporter, permease protein UrtC  46.2 
 
 		 384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2258  urea ABC transporter, permease protein UrtC  45.22 
 
 		 398 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0827  putative membrane protein of urea ABC transport system  44.73 
 
 		 376 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3862  inner-membrane translocator  46.5 
 
 		 383 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.938574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2864  urea ABC transporter, permease protein UrtC  44.97 
 
 		 385 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0595  urea ABC transporter, permease protein UrtC  45.82 
 
 		 384 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0702  urea ABC transporter, permease protein UrtC  48.51 
 
 		 409 aa  264  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1254  inner-membrane translocator  45.9 
 
 		 383 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2203  inner-membrane translocator  43.73 
 
 		 380 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5510  urea ABC transporter, permease protein UrtC  46.51 
 
 		 390 aa  262  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.762054 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19171  putative membrane protein of urea ABC transport system  42.94 
 
 		 375 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.514587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3570  urea ABC transporter, permease protein UrtC  46.13 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.107827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3114  urea ABC transporter, permease protein UrtC  45.03 
 
 		 382 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1101  urea ABC transporter, permease protein UrtC  41.98 
 
 		 383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3688  urea ABC transporter, permease protein UrtC  46.04 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3379  urea ABC transporter, permease protein UrtC  46.04 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2988  ABC transporter inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 390 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.641521 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2248  putative membrane protein of ABC transport system  44.35 
 
 		 375 aa  256  5e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1046  putative membrane protein of urea ABC transport system  43.97 
 
 		 371 aa  255  7e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.812032  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0656  branched chain amino acid ABC transporter permease  49.06 
 
 		 379 aa  255  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.370011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0950  inner-membrane translocator  41.35 
 
 		 377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00883  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  40.48 
 
 		 392 aa  253  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2618  urea ABC transporter, permease protein UrtC  43.64 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4151  inner-membrane translocator  41.57 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2594  inner-membrane translocator  45.79 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4607  urea ABC transporter, permease protein UrtC  42.11 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2618  putative membrane protein of urea ABC transport system  41.99 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0303421  normal  0.395432 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3933  urea ABC transporter, permease protein UrtC  41.59 
 
 		 414 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2999  inner-membrane translocator  40.66 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1445  urea ABC transporter, permease protein UrtC  41.72 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808643 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2697  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system  40.11 
 
 		 367 aa  243  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.611923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4010  urea ABC transporter, permease protein UrtC  39.32 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4428  inner-membrane translocator  41.25 
 
 		 359 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3865  inner-membrane translocator  46.32 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29721  putative membrane protein of urea ABC transport system  44.29 
 
 		 375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3379  inner-membrane translocator  40.87 
 
 		 367 aa  239  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4900  urea ABC transporter, permease protein UrtC  42.24 
 
 		 359 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153709 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4887  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.25 
 
 		 359 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599919  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0228  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like  42.52 
 
 		 432 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.836611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0190  inner-membrane translocator  42.9 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2744  urea ABC transporter, permease protein UrtC  42.27 
 
 		 358 aa  237  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1502  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 		 401 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4843  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  42.55 
 
 		 359 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.227032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4635  urea ABC transporter, permease protein UrtC  41.93 
 
 		 359 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4721  inner-membrane translocator  42.55 
 
 		 359 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131365  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0699  putative permease transporter transmembrane protein  39.38 
 
 		 378 aa  235  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0568286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3129  putative branched-chain amino acid transport system, permease component  41.18 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0999  inner-membrane translocator  39.72 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1200  inner-membrane translocator  38.84 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.729253  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1021  inner-membrane translocator  40.52 
 
 		 384 aa  233  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.744628  normal  0.313599 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3105  putative amino acid ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 		 400 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3069  putative amino acid ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 		 400 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2563  putative amino acid ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.589249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2178  branched-chain ABC transporter, permease protein, putative  41.18 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0730  putative amino acid ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0588  inner-membrane translocator  41.56 
 
 		 359 aa  232  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.98768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2050  putative amino acid ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.525267  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0785  inner-membrane translocator  42.01 
 
 		 394 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3498  inner-membrane translocator  40.29 
 
 		 385 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4012  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.83 
 
 		 395 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0110439  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0429  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 395 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0908  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 395 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2484  urea ABC transporter, permease protein UrtC  41.18 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1257  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  41.8 
 
 		 363 aa  231  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.606412 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1395  inner-membrane translocator  39.44 
 
 		 377 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal  0.615591 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0878  urea ABC transporter, permease protein UrtC  41.69 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3500  urea ABC transporter, permease protein UrtC  50.16 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal  0.196698 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0952  urea ABC transporter, permease protein UrtC  41 
 
 		 394 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1436  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 371 aa  229  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3685  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.21 
 
 		 393 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3508  inner-membrane translocator  41.85 
 
 		 397 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0796  urea ABC transporter, permease protein UrtC  41.69 
 
 		 394 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>