More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3800 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3800  inner-membrane translocator  100 
 
 
370 aa  716    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2594  inner-membrane translocator  91.89 
 
 
370 aa  592  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2336  inner-membrane translocator  85.41 
 
 
367 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112184  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2289  inner-membrane translocator  85.41 
 
 
367 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995784  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2328  inner-membrane translocator  85.41 
 
 
367 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228021  normal  0.0755161 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0702  urea ABC transporter, permease protein UrtC  69.03 
 
 
409 aa  410  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000476428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1672  urea ABC transporter, permease protein UrtC  57.88 
 
 
392 aa  348  6e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3238  urea ABC transporter, permease protein UrtC  52.51 
 
 
368 aa  332  6e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689363  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3500  urea ABC transporter, permease protein UrtC  56.19 
 
 
373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal  0.196698 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1821  inner-membrane translocator  45.07 
 
 
382 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0978  urea ABC transporter, permease protein UrtC  44.88 
 
 
376 aa  279  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903791  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2776  urea ABC transporter, permease protein UrtC  46.33 
 
 
352 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1709  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  46.11 
 
 
387 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0393894  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2973  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.31 
 
 
383 aa  279  7e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.604364  normal  0.198493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4076  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45 
 
 
391 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4908  inner-membrane translocator  45.23 
 
 
351 aa  275  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1773  inner-membrane translocator  41.98 
 
 
389 aa  275  9e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.874447  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5670  urea ABC transporter, permease protein UrtC  47.96 
 
 
389 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4634  inner-membrane translocator  47.34 
 
 
389 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3734  inner-membrane translocator  47.34 
 
 
389 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2005  urea ABC transporter, permease protein UrtC  47.16 
 
 
361 aa  269  5e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4363  inner-membrane translocator  41.97 
 
 
372 aa  263  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283933  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0566  inner-membrane translocator  42.13 
 
 
411 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3589  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.73 
 
 
404 aa  259  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1595  urea ABC transporter, permease protein UrtC  43.24 
 
 
384 aa  258  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0222  urea ABC transporter, permease protein UrtC  44.41 
 
 
396 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1445  urea ABC transporter, permease protein UrtC  42.77 
 
 
383 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2258  urea ABC transporter, permease protein UrtC  42.65 
 
 
398 aa  255  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0595  urea ABC transporter, permease protein UrtC  45.4 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3143  urea ABC transporter, permease protein UrtC  43.9 
 
 
401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3570  urea ABC transporter, permease protein UrtC  44.91 
 
 
393 aa  249  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.107827  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0128  inner-membrane translocator  41.49 
 
 
393 aa  249  8e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2203  inner-membrane translocator  44.28 
 
 
380 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148404  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3379  urea ABC transporter, permease protein UrtC  46.65 
 
 
393 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3688  urea ABC transporter, permease protein UrtC  46.65 
 
 
393 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1254  inner-membrane translocator  44.21 
 
 
383 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3862  inner-membrane translocator  44.12 
 
 
383 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.938574  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3114  urea ABC transporter, permease protein UrtC  44.23 
 
 
382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2864  urea ABC transporter, permease protein UrtC  41.57 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2416  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.98 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5510  urea ABC transporter, permease protein UrtC  46.65 
 
 
390 aa  243  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.762054 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08861  putative membrane protein of urea ABC transport system  40.89 
 
 
376 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19171  putative membrane protein of urea ABC transport system  40.06 
 
 
375 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.514587  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08841  putative membrane protein of urea ABC transport system  40.58 
 
 
376 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2999  inner-membrane translocator  41.19 
 
 
377 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2988  ABC transporter inner-membrane translocator  40.79 
 
 
390 aa  237  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.641521 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0827  putative membrane protein of urea ABC transport system  40.26 
 
 
376 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1200  inner-membrane translocator  39.1 
 
 
380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.729253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4151  inner-membrane translocator  40.12 
 
 
375 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3933  urea ABC transporter, permease protein UrtC  40.3 
 
 
414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00883  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  37.9 
 
 
392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0699  putative permease transporter transmembrane protein  40.19 
 
 
378 aa  234  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0568286  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2248  putative membrane protein of ABC transport system  42.46 
 
 
375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1046  putative membrane protein of urea ABC transport system  41.69 
 
 
371 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.812032  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0950  inner-membrane translocator  38.48 
 
 
377 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0656  branched chain amino acid ABC transporter permease  43.28 
 
 
379 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.370011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2744  urea ABC transporter, permease protein UrtC  41.3 
 
 
358 aa  230  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1436  inner-membrane translocator  39.42 
 
 
371 aa  230  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1101  urea ABC transporter, permease protein UrtC  39.31 
 
 
383 aa  229  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0588  inner-membrane translocator  40.99 
 
 
359 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.98768  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2697  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system  39.27 
 
 
367 aa  229  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.611923  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3491  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  37.79 
 
 
386 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4010  urea ABC transporter, permease protein UrtC  36.44 
 
 
405 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4887  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.18 
 
 
359 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599919  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3379  inner-membrane translocator  38 
 
 
367 aa  226  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0429  inner-membrane translocator  39.74 
 
 
395 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0785  inner-membrane translocator  40.06 
 
 
394 aa  226  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0908  inner-membrane translocator  39.74 
 
 
395 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4428  inner-membrane translocator  38.87 
 
 
359 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4012  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.74 
 
 
395 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0110439  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1502  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.01 
 
 
401 aa  225  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4635  urea ABC transporter, permease protein UrtC  41.38 
 
 
359 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3865  inner-membrane translocator  46.01 
 
 
399 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2178  branched-chain ABC transporter, permease protein, putative  38.7 
 
 
340 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3069  putative amino acid ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 
400 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2484  urea ABC transporter, permease protein UrtC  39.42 
 
 
406 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3105  putative amino acid ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 
400 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2563  putative amino acid ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 
340 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.589249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2050  putative amino acid ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 
340 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.525267  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4900  urea ABC transporter, permease protein UrtC  41.07 
 
 
359 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0153709 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4227  urea ABC transporter, permease protein UrtC  38.22 
 
 
418 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.338662  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0730  putative amino acid ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 
340 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0878  urea ABC transporter, permease protein UrtC  39.74 
 
 
395 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1257  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  36.45 
 
 
363 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.606412 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0999  inner-membrane translocator  37.89 
 
 
403 aa  224  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0796  urea ABC transporter, permease protein UrtC  39.51 
 
 
394 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1445  urea ABC transporter, permease protein UrtC  39.29 
 
 
384 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4843  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  41.38 
 
 
359 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.227032 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3129  putative branched-chain amino acid transport system, permease component  38.7 
 
 
400 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4721  inner-membrane translocator  41.38 
 
 
359 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131365  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3498  inner-membrane translocator  38.06 
 
 
385 aa  222  7e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1395  inner-membrane translocator  37.43 
 
 
377 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal  0.615591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0952  urea ABC transporter, permease protein UrtC  39.88 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3685  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.88 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2253  urea ABC transporter, permease protein UrtC  39.3 
 
 
398 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.731994  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3209  inner-membrane translocator  38.18 
 
 
372 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0890625  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2618  putative membrane protein of urea ABC transport system  38.66 
 
 
382 aa  219  7e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0303421  normal  0.395432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2618  urea ABC transporter, permease protein UrtC  38.79 
 
 
382 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1086  urea ABC transporter, permease protein UrtC  38.72 
 
 
372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1868  urea ABC transporter, permease protein UrtC  35.43 
 
 
389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514988  normal  0.284901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>