272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1872 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0882  response regulator receiver domain-containing protein  64.71 
 
 		 131 aa  157  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489217  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0923  response regulator receiver protein  64.71 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  59.17 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  55.22 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2901  putative transcription regulator protein  57.72 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4107  response regulator receiver protein  55.22 
 
 		 137 aa  144  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2455  response regulator receiver domain-containing protein  57.26 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275006  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2831  response regulator receiver protein  52.55 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3861  response regulator receiver protein  57.98 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766529 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3508  response regulator receiver protein  50.36 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2734  response regulator receiver protein  54.31 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3636  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3994  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73116  normal  0.876977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0607  response regulator receiver domain-containing protein  48.28 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000161034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6326  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4742  response regulator receiver domain-containing protein  43.1 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.881112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  41.41 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0398  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151817 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  36.94 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1245  DNA-binding response regulator,, putative  35.14 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.841287  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0128  response regulator  34.82 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.450595  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2655  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.822475  normal  0.523205 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0181  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.66 
 
 		 737 aa  63.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  34.78 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1553  response regulator  34.82 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1635  response regulator  34.82 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  27.34 
 
 		 223 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.86 
 
 		 403 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  32.09 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  30.17 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  32.5 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  32.5 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4295  response regulator receiver domain-containing protein  34.19 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5997  response regulator receiver protein  38.3 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5812  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.113001 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0122  response regulator receiver  34.45 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.940533  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  30.48 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1169  response regulator receiver domain-containing protein  30.3 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  30.48 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  30.48 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  30.48 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  30.48 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  30.48 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  30.48 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  30.48 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  32.32 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  29.52 
 
 		 226 aa  53.9  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0091  response regulator receiver domain-containing protein  34.23 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1507  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  39.44 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1894  sporulation transcriptional activator Spo0A  32.52 
 
 		 281 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258911  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1849  response regulator receiver domain-containing protein  30.91 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5989  response regulator receiver protein  41.43 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  29.52 
 
 		 214 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3765  response regulator receiver protein  38.03 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238428  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1218  response regulator receiver  30.43 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 252 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  28.97 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3611  response regulator receiver protein  28.04 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194602  normal  0.24428 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1864  two component LuxR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3597  response regulator receiver and unknown domain protein  31.73 
 
 		 228 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  27.62 
 
 		 214 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  27.62 
 
 		 214 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  28.57 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 207 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1914  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 		 815 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.979442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  34.15 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1337  sporulation transcriptional activator Spo0A  25.38 
 
 		 267 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.190748  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 220 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1954  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.67 
 
 		 464 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1235  two component LuxR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 211 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.91 
 
 		 352 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0445779 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  32.88 
 
 		 225 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  24.56 
 
 		 209 aa  47.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 242 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.89 
 
 		 205 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0293  two component LuxR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 222 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4452  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421397  normal  0.0817611 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.73 
 
 		 236 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0965  response regulator receiver protein  25.62 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00737627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 242 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6106  response regulator receiver protein  26.72 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0944  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.25 
 
 		 344 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0246262  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12780  putative two-component response regulator  29.36 
 
 		 209 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1798  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 466 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.634231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.72 
 
 		 220 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 204 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  25.93 
 
 		 229 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>