More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0791 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  264  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1169  response regulator receiver domain-containing protein  74.19 
 
 		 129 aa  184  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4295  response regulator receiver domain-containing protein  66.67 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  38.21 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  40 
 
 		 136 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  40 
 
 		 136 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  40 
 
 		 136 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.37 
 
 		 403 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03380  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.48 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.23 
 
 		 201 aa  84  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1245  DNA-binding response regulator,, putative  36.15 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.841287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0128  response regulator  36.59 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.450595  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5812  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.113001 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1635  response regulator  35.77 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1553  response regulator  35.77 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  37.4 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.71 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  35.59 
 
 		 219 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.28 
 
 		 223 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.04 
 
 		 204 aa  73.6  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1123  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.52 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  34.75 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2375  two component LuxR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.405291  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2613  response regulator GacA  30.7 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30650  response regulator GacA  30.7 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  31.3 
 
 		 214 aa  70.1  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  38.14 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3765  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238428  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  33.91 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3024  DNA-binding response regulator GacA  30.7 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1526  two component transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.88337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2897  LuxR response regulator receiver  30.7 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.017691  normal  0.317002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3028  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.66 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  decreased coverage  0.0000266978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3375  two component LuxR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1765  two component LuxR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456405  hitchhiker  0.00257365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4099  DNA-binding response regulator GacA  30.7 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3672  two component LuxR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  hitchhiker  0.000000290511 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  32.46 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2132  two component LuxR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0449794  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 224 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.05 
 
 		 218 aa  67.8  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.44 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.705317  normal  0.304873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1720  LuxR family two component transcriptional regulator  32.46 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.96 
 
 		 224 aa  67.4  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 197 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4753  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 201 aa  67  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 222 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.96 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  31.2 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1122  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.752968  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  30.33 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0726  response regulator  29.82 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3067  two component LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.82 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.29 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3326  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.61 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.97 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1239  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0482404  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2019  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 1648 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2798  response regulator receiver  29.1 
 
 		 306 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.151747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  34.95 
 
 		 213 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  31.71 
 
 		 221 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0830  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 211 aa  63.9  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25030  Response regulator GacA  28.18 
 
 		 209 aa  64.3  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 210 aa  64.3  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 216 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.65 
 
 		 218 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 212 aa  63.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3636  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  30.7 
 
 		 224 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5557  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 223 aa  63.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2054  response regulator receiver domain-containing protein  28.32 
 
 		 198 aa  63.5  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595634 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.74 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1079  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.21 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.0499592 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1191  two component LuxR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>