More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4011 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  100 
 
 		 136 aa  269  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  100 
 
 		 136 aa  269  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  100 
 
 		 136 aa  269  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  92.48 
 
 		 134 aa  244  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  88.72 
 
 		 134 aa  233  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  91.79 
 
 		 135 aa  217  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3765  response regulator receiver protein  90.3 
 
 		 135 aa  215  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238428  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1245  DNA-binding response regulator,, putative  55.15 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.841287  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1553  response regulator  54.81 
 
 		 136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1635  response regulator  54.81 
 
 		 136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0128  response regulator  54.81 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.450595  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5812  response regulator receiver protein  54.47 
 
 		 138 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.113001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50 
 
 		 403 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1849  response regulator receiver domain-containing protein  47.62 
 
 		 143 aa  110  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  40 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4295  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1169  response regulator receiver domain-containing protein  36 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  30.94 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  30.94 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  38.21 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2655  response regulator receiver protein  30.28 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.822475  normal  0.523205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  30.94 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0091  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1218  response regulator receiver  35.19 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0122  response regulator receiver  36.22 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.940533  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1507  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  27.34 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3416  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.5 
 
 		 237 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0577965 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4452  response regulator receiver domain-containing protein  33.07 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421397  normal  0.0817611 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  33.61 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  35.14 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0882  response regulator receiver domain-containing protein  32.43 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489217  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  34.45 
 
 		 214 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3861  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766529 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  26.56 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0830  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  33.33 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03380  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.71 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4107  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0726  response regulator  30.25 
 
 		 211 aa  62  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1285  two component LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000337392  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.71 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1775  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.71 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.814588  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0923  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0043  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 223 aa  60.5  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  30 
 
 		 214 aa  60.5  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1864  two component LuxR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  30.71 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  37.04 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2831  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3508  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3070  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000689776  unclonable  0.00000000000283062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1319  two component LuxR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0542522  decreased coverage  0.000972679 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 		 352 aa  58.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0445779 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  28.46 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.32 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1241  two component LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000399601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  27.69 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3636  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  33.01 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  33.01 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3055  response regulator receiver  31.36 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  28.46 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  33.01 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  33.01 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  33.01 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  33.01 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2798  response regulator receiver  26.98 
 
 		 306 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.151747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  33.01 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  30.08 
 
 		 214 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  28.46 
 
 		 215 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  28.46 
 
 		 215 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  28.46 
 
 		 215 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  28.46 
 
 		 215 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  28.07 
 
 		 223 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  28.46 
 
 		 215 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 219 aa  57.4  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5940  LuxR family response regulator  30.17 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000781929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0541  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.92 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  28.46 
 
 		 215 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  32.67 
 
 		 226 aa  57.4  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1122  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.4 
 
 		 234 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.752968  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1151  two component LuxR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 225 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 219 aa  57  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1222  two component LuxR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 225 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  33.01 
 
 		 214 aa  57  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  37.36 
 
 		 221 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  31.2 
 
 		 214 aa  57  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  34.29 
 
 		 220 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1152  two component LuxR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 225 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 215 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>