More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3765 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3765  response regulator receiver protein  100 
 
 		 135 aa  266  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238428  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  97.04 
 
 		 135 aa  236  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  90.3 
 
 		 136 aa  234  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  90.3 
 
 		 136 aa  234  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  90.3 
 
 		 136 aa  234  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  85.19 
 
 		 134 aa  223  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  83.7 
 
 		 134 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1245  DNA-binding response regulator,, putative  58.14 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.841287  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1635  response regulator  56.15 
 
 		 136 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1553  response regulator  56.15 
 
 		 136 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0128  response regulator  56.15 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.450595  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5812  response regulator receiver protein  54.84 
 
 		 138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.113001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.34 
 
 		 403 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1849  response regulator receiver domain-containing protein  49.28 
 
 		 143 aa  110  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4295  response regulator receiver domain-containing protein  39.17 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0122  response regulator receiver  37.8 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.940533  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  38.46 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1169  response regulator receiver domain-containing protein  32 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0091  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  30.22 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3416  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.61 
 
 		 237 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0577965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1218  response regulator receiver  36.11 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  35.29 
 
 		 214 aa  67  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  36.97 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  28.91 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  28.91 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2655  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.822475  normal  0.523205 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  34.17 
 
 		 227 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1507  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  32 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  26.52 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03380  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.79 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0830  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 211 aa  60.8  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0882  response regulator receiver domain-containing protein  31.53 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489217  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3357  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0726  response regulator  29.41 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0923  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4452  response regulator receiver domain-containing protein  34.58 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421397  normal  0.0817611 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.65 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.2 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  32.23 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2039  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 476 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  35.25 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3636  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  34.95 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  34.95 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  34.95 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  34.95 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  34.95 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4107  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  34.95 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  34.95 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  32.23 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  33.98 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5940  LuxR family response regulator  30.17 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000781929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  30 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  34.95 
 
 		 214 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  35 
 
 		 218 aa  57.4  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  32.23 
 
 		 216 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  25.55 
 
 		 155 aa  57  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  30.58 
 
 		 214 aa  57  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5714  two component LuxR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 210 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2132  two component LuxR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0449794  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  35.24 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  29.17 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4359  ATPase domain-containing protein  32.31 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191758  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3861  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766529 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2831  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003098  BarA-associated response regulator UvrY  39.13 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000268807  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2730  response regulator receiver  33.33 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.776601  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3508  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  29.75 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  37.27 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1102  LuxR family DNA-binding response regulator  25.42 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  30.51 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1775  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.25 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.814588  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  30.58 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.65 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  28.21 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2375  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.405291  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1222  two component LuxR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1873  response regulator receiver protein  29.25 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0398  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151817 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  30.51 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>